FPKM在很久之前的应用比较多，现在用TPM比较多，可以将FPKM先转化为TPM，再进行log2(TPM + 1)处理，...
count、tpm、fpkm等表达量差异 在进行差异分析、生存分析等下游分析时,有很多粉丝朋友对到底使用哪种类型的数据非常纠结,所以我们今天比较一下counts、tpm、fpkm、vst、cpm的表达量差异,让大家对这些数据类型有一个直观的感受。 03 python装饰器 https://www.liaoxuefeng.com/wiki/1016959663602400/1017451662295584 01 信...
R语言 | GEO数据库表达矩阵标准化 ✴️前言:我们从GEO数据库下载得到表达矩阵,在进行各种分析之前,首先要做的就是对数据进行标准化。 05 决策树算法之---C4.5 1. C4.5算法简介 C4.5是一系列用在机器学习和数据挖掘的分类问题中的算法。它的目标是监督学习:给定一个数据集,其中的每一个元组都能用一组属性...
#RSEM定量后直接生成FPKM,无需标准化#RNA-seq下游-1有些混乱,重新整理#与原文存在差异的原因是原文mRNA-seq要对注释gtf文件对进行过滤甲基化区域和polyA尾以及原文用的hg19...---title: "RNAseq-下游分析-2"output: html_documentdate: "2023-10-26"---R Markdown#RSEM定量后直接生成FPKM,无需标准化#RNA-...
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