老师，请问您是如何用limma包去筛选差异表达基因的，现在真的很需要您的帮助
然后才是具体的包内容。包括这些包分析的差异性，教会学生什么时候用DESeq2什么时候用limma。最后，通过...
举个从GEO数据库下载的样例,逐步介绍RMA进行CEL表达谱数据标准化,以及limma算法提取差异表达基因的过程。 source("链接") biocLite("affy") biocLite("Biobase") biocLite("tkWidgets") library(affy) AffyData<-ReadAffy(widget=TRUE) exprsSet.RMA<-rma(AffyData)##用rma方法处理数据 ...
Bioconductor package limma 青云英语翻译 请在下面的文本框内输入文字,然后点击开始翻译按钮进行翻译,如果您看不到结果,请重新翻译! 翻译结果1翻译结果2翻译结果3翻译结果4翻译结果5 翻译结果1复制译文编辑译文朗读译文返回顶部 Bioconductor的包LIMMA 翻译结果2复制译文编辑译文朗读译文返回顶部...
大家都知道,这十几年来最流行的差异分析软件就是R的limma包了,但是它以前只支持microarray的表达数据。 考虑到大家都熟悉了它,它又发了一个voom的方法,让它从此支持RNA-seq的count数据啦! 大家都知道芯片数据跟RNA-seq数据的本质就是value的分布不一样,所以各种针对RNA-seq的差异分析包也就是提出来一个新的norma...
然后才是具体的包内容。包括这些包分析的差异性，教会学生什么时候用DESeq2什么时候用limma。最后，通过...