Bioconductor package limma 青云英语翻译 请在下面的文本框内输入文字,然后点击开始翻译按钮进行翻译,如果您看不到结果,请重新翻译! 翻译结果1翻译结果2翻译结果3翻译结果4翻译结果5 翻译结果1复制译文编辑译文朗读译文返回顶部 Bioconductor的包LIMMA 翻译结果2复制译文编辑译文朗读译文返回顶部...
举个从GEO数据库下载的样例,逐步介绍RMA进行CEL表达谱数据标准化,以及limma算法提取差异表达基因的过程。 source("链接") biocLite("affy") biocLite("Biobase") biocLite("tkWidgets") library(affy) AffyData<-ReadAffy(widget=TRUE) exprsSet.RMA<-rma(AffyData)##用rma方法处理数据 exp.RMA<-exprs(exprsSet...
使用这个包也需要三个数据: 表达矩阵 分组矩阵 差异比较矩阵 用法与limma一模一样的,只是多了一个normalization而已。 读取自己的数据 一般我们会自己读取表达矩阵和分组信息,下面是一个例子: options(warn=-1)suppressMessages(library(DESeq2))suppressMessages(library(limma))suppressMessages(library(pasilla))data(p...