无论是在进行全基因组关联研究(GWAS)还是孟德尔随机化研究(MR)中,我们都需要考虑SNP间的连锁不平衡(LD)信息,这里小陈给大家简单介绍一下用于LD分析的工具---LDlink(https://ldlink.nci.nih.gov/?tab=home),使用这个网站时最好使用代理服务器,这样比较稳定,当然不使用代理的话,有时候也是可以使用的。 进入...
从上面的解读中不难看出,随着r2的变小与kb的变大,被去除的存在连锁不平衡的SNP会越来越多,而最终剩下的IV会越来越少。在我之前的推送中曾以实例和大家探讨了IV数目对结果的影响(孟德尔随机化之高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)与心肌梗死的因果关系),一般IV个数越少,存在的混杂和多效性也就越少,但相应的统计效力...