FDR表示的是信度,而不是富集程度或P值的大小.一般来说,FDR越小,表示该通路的富集结果越可靠.在KEGG通路分析中,你应该关注那些FDR值较小的通路,因为它们更可能是真正与你的研究相关的通路.
定位
网络 KEGG通路;pathway 英[ˈpɑ:θweɪ] 美[ˈpæθweɪ]n. 路，道; 途径，路径;[例句]Richard was coming up the pathway.理查德正沿着小路走过来。[其他] 复数：pathways
点击K00844则这一KO分类信息及成员列表都可显示出来;点击has则链接到物种(人类)基因组去了;点击P,则显示相应的代谢通路。下面我们点击3101,如下: 如上图,就是我们常见的一个页面,3101是KEGG中的基因ID(登录号),H.sapiens表示物种,然后是基因的名称,表达的酶,属于哪个KO分类以及参与哪些代谢途径;下面还有结构、序...
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ID表示KEGG的PATHWAY数据库中途径标识，Description是该通路的描述，setSize：富集到该通路下的基因数，enrichmentScore是富集分数，NES表示归一化后的富集分数， pvalue是p值，p.adjust表示矫校正过的p值，qvalue是q值，rank是在基因集中对ES分数贡献最大的核心基因在基因表排序中的位置（按照log2FC从大到小的排序）...
点击K00844则这一KO分类信息及成员列表都可显示出来;点击has则链接到物种(人类)基因组去了;点击P,则显示相应的代谢通路。下面我们点击3101,如下: 如上图,就是我们常见的一个页面,3101是KEGG中的基因ID(登录号), H.sapiens表示物种,然后是基因的名称,表达的酶,属于哪个KO分类以及参与哪些代谢途径;下面还有结构、...
点击K00844则这一KO分类信息及成员列表都可显示出来;点击has则链接到物种(人类)基因组去了;点击P,则显示相应的代谢通路。下面我们点击3101,如下:如上图,就是我们常见的一个页面,3101是KEGG中的基因ID(登录号),H.sapiens表示物种,然后是基因的名称,表达的酶,属于哪个KO分类以及参与哪些代谢途径;下面还有结构、序列...
空白则表示在该物种中不存在这种酶。点击K00844则这一KO分类信息及成员列表都可显示出来；点击has则链接到物种（人类）基因组去了；点击P，则显示相应的代谢通路。下面我们点击3101，如下：如上图，就是我们常见的一个页面，3101是KEGG中的基因ID（登录号），H.sapiens表示物种，然后是基因的名称，表达的酶，属于...
询证的意思 询证含义解释 询证[xún zhèng] 询证作为审计中一种常用的程序和方法,它包括查询和函证。 查询是审计人员对有关人员进行书面或口头询问以获取审计证据的方法。函证是指审计人员为印证被审计单位会计记录所载事项而向第三者发函询证的一种方法。