在分析某一特定基因的预后价值时,Kaplan-meier Plotter数据库以该基因表达量的不同分位数为标准将患者分为两组,通过Kaplan-meimer生存图对两个队列进行比较并计算出HR,95%CI以及logrank P值。目前数据库对于mRNA水平的研究证据最为充分,miRNA、DNA以及蛋白水平的研究也在飞速发展,这些分子在Kaplan-meier Plotter数据...
一、数据库简介Kaplan-MeierPlotter(http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background)是常用的进行生存分析的网站,其数据来源于GEO、EGA、TCGA数据库,可针对54,675 个基因、18,674个癌症样本展开研究,评估在21种癌症中54000个基因对生存率的影响,查看...
Kaplan-meierPlotter数据库通过整合基因表达信息以及临床预后价值进行Meta分析以及生存相关分子标志物的研究、发现以及验证。在分析某一特定基因的预后价值时,Kaplan-meierPlotter数据库以该基因表达量的不同分位数为标准将患者分为两组,通过Kaplan-meimer生存图对两个队列进行比较并计算出HR,95%CI以及logrankP值。目前...
Our aim was to develop an online Kaplan-Meier plotter which can be used to assess the effect of the genes on breast cancer prognosis.
Kaplan-Meier Plotter(http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background)是常用的进行生存分析的网站,其数据来源于GEO、EGA、TCGA数据库,能够评估来自21种肿瘤的30000多个样本中所有基因的表达与患者生存率之间的相关性,从而发现和验证与生存相关的生物标志物。
1、打开Kaplan-Meier Plotter网站http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background 下拉(图1): 图1 Kaplan-Meier Plotter主页 TP53是编码基因,因此我们应该选择mRNA。可以发现第一行是基于mRNA的基因芯片数据进行生存分析,但只有乳腺癌、卵巢癌、肺癌和胃癌可选;第二行是基于mRNA的RNA测序数据进行生存分析,其中...
Our aim was to develop an online Kaplan-Meier plotter which can be used to assess the effect of the genes on breast cancer prognosis.
Our aim was to develop an online Kaplan-Meier plotter which can be used to assess the effect of the genes on breast cancer prognosis.
在医学研究领域，生存分析是研究某一因素对患者生存期影响的常用方法。零基础学习生存分析，Kaplan-Meier Plotter数据库是适合初学者的工具，其数据来源广泛，能评估基因与患者生存率的相关性，用于发现生物标志物。接下来，我们将通过探究TP53基因在肝癌患者中的表达与生存率关系，演示如何使用Kaplan-Meier ...
进入该网站的首页,可以看到强大的Kaplan Meier plotter网站,能够评估5.4万个基因在21种癌症类型中的作用,其中有4种癌症数据比较齐全,分别为乳腺癌、卵巢癌、肺癌和胃癌。 下面具体讲解怎样使用该数据库。 操作步骤: 点击start KM plot for breast cancer,进入乳腺癌生存分析界面。在这一页中,我们可以根据基因的名字或...