1.打开Kaplan-Meier Plotter网站https://kmplot.com/analysis/ TP53是编码基因,因此我们应该选择mRNA。可以发现第一行是基于mRNA的基因芯片数据进行生存分析,但只有乳腺癌、卵巢癌、肺癌和胃癌可选;第二行是基于mRNA的RNA测序数据进行生存分析,其中乳腺癌和肝...
Kaplan-Meier Plotter(http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background)是常用的进行生存分析的网站,其数据来源于GEO、EGA、TCGA数据库,能够评估来自21种肿瘤的30000多个样本中所有基因的表达与患者生存率之间的相关性,从而发现和验证与生存相关的生物标志物。 下面就以探究基因TP53的表达与肝癌患者生存率的关系为...
Kaplan-Meier Plotter(http://kmplot.com/analysis/index.php?p=background)是常用的进行生存分析的网站,其数据来源于GEO、EGA、TCGA数据库,能够评估来自21种肿瘤的30000多个样本中所有基因的表达与患者生存率之间的相关性,从而发现和验证与生存相关的生物标志物。 下面就以探究基因TP53的表达与肝癌患者生存率的关系为...
零基础学习生存分析，Kaplan-Meier Plotter数据库是适合初学者的工具，其数据来源广泛，能评估基因与患者生存率的相关性，用于发现生物标志物。接下来，我们将通过探究TP53基因在肝癌患者中的表达与生存率关系，演示如何使用Kaplan-Meier Plotter进行生存分析。首先，访问Kaplan-Meier Plotter网站（http://kmplot...
Kaplan Meier plotter能够评估54k基因(mRNA,miRNA,蛋白质)对21种癌症类型(包括乳腺癌(n = 6,234),卵巢癌(n = 2,190),肺癌(n = 3,452)和胃癌)的存活率的影响 (n = 1,440)。Kaplan Meier plotter 数据库的来源包括GEO,EGA和TCGA。 该工具的主要目的是基于荟萃分析的生存生物标记物的发现和验证。
今天我们再介绍一款生存分析的经典数据库,Kaplan-meier Plotter数据库,其操作上的选择更为丰富,图片可以直接用于论文无需后期处理,可以与PrognoScan数据库进行相互补充,称得上预后分析数据库的老大哥了。目前,使用Kaplan-meier Plotter数据库发表的论文刊登在了Cell、Nature、Cancer Discovery等著名期刊上,值得大家进行学习和掌...
进入该网站的首页,可以看到强大的Kaplan Meier plotter网站,能够评估5.4万个基因在21种癌症类型中的作用,其中有4种癌症数据比较齐全,分别为乳腺癌、卵巢癌、肺癌和胃癌。 下面具体讲解怎样使用该数据库。 操作步骤: 点击start KM plot for breast cancer,进入乳腺癌生存分析界面。在这一页中,我们可以根据基因的名字或...
本文通过Oncomine和Kaplan-Meier Plotter数据库分析ZWINT在乳腺癌中的表达情况及其与患者预后的相关性,发现与正常乳腺组织相比,ZWINT在乳腺癌组织中高表达(P=4.05×10-6),并且,通过生存分析发现,高表达ZWINT的乳腺癌患者的总生存OS (HR=1.7...
Our aim was to develop an online Kaplan-Meier plotter which can be used to assess the effect of the genes on breast cancer prognosis.
Our aim was to develop an online Kaplan-Meier plotter which can be used to assess the effect of the genes on breast cancer prognosis.