ITK-SNAP打开..我用unet做医疗影像分割,输出的结果,转化成nii.gz文件,但ITK软件不能打开,一直报错,求大佬看一下,跪求!!!顶一下
数据标注为nii.gz,可以用ITK-SNAP打开 类别:0. 背景 1. 脾脏 2. 右肾 3. 左肾 4. 胆囊 5. 食道 6. 肝脏 7. 胃 8. 主动脉 9. 下腔静脉 10. 门静脉和脾静脉 11. 胰腺 12 右肾上腺 13 左肾上腺(具体英文类别参考json文件) 关于unet的分割项目:https://blog.csdn.net/qq_44886601/article/...
基于MRI成像下的人体脊柱(spine)3D分割数据集(nii.gz格式) 数据为基于MRI成像下的人体脊柱(spine)3D分割数据集(nii.gz格式) 共有100个样本,以及对应的标签文件。数据标注为nii.gz,可以用ITK-SNAP打开 标签类别可以参考json文件 0 = Background 1-9 = L5 through T9 (vertebrae) 10 = Spinal Canal 11-19 ...
使用itk-snap软件,将dcm文件序列转换成nii.gz格式的单个文件。 知识 野生技能协会 视频教程 评论25 最热 最新 请先登录后发表评论 (・ω・) 发布 超硬核STEM_Girl up主你好,请问如果要把医学图像输入卷积神经网络进行学习,nii.gz格式的话可以直接作为输入吗,还是要转换成PNG或是其他格式呢 2020-03-01 17:11...
2.利用软件ITK-SNAP把一幅图像中自己想要的部分抠出来 步骤: 1.保存mask 打开ITK-SNAP ,这是一款可以方便进行勾画操作,制作标签的软件 1.点击勾画按钮 2.在图像中选点进行勾画 3.勾画完成后点击accept,可以看到所勾画的区域被标签颜色所覆盖 4.滚动鼠标滚轮到下一层(对于3D图像),继续勾画 ...
此时可以看出来,这个nii文件将两个三维图像放在了一起,形成了类似四维的图像。之所以我不把它叫做四维图像,是因为我认为像核磁共振图那样包含时间信息的序列才可以被称作是真正的四维图像文件。 Anyway,我更关心的是另一半的图像究竟是个什么样子,因此我需要在itk-snap中打开它。查阅官方文档后,我发现虽然没有如何查看...
很多题都会要求读取txt作为输入。 头文件 fstream 打开文件 ifstream inputData("/cpp/input.txt"); ...
软件下载链接: ITK-SNAP Home 1、导入医学图像( nii.gz文件) File->Open Main Image 点击 Browse... (切记不能有中文路径) -> Next 2、载入相应的分割图数据( nii.gz文件) Segmentation - > Open Segmentation -> Browse... -> Next 3、3D可视化 ... ...
...import SimpleITKas sitkitk_img = sitk.ReadImage(‘a.mhd’) img_array = sitk.GetArrayFromImage(itk_img...NIfTI格式的nii数据同样可以用ITK-SNAP软件打开,在python中同上采用SimpleITK包来处理。...2.3D可视化 由于ITK-SNAP的展示界面不够立体直观,可以借助paraview来展示我们的分割结果。 将分割好的....
本吧热帖: 1-ITK-SNAP医学影像处理软件无法打开问题 2-itk读取图像出错。。望各位大神解救。。 3-[安装问题]No CMAKE_CXX_COMPILER could be found. 4-[求教]入门问题:无法正确读图 5-各位大咖 请问ITK可以把标注好的ROI区域自动扩大吗? 6-itk—snap界面 7-保留数据文件重