分析表明,溶细胞活性较高的肿瘤具有较多的HLA LOH(图5A)。在所有免疫亚型中,C2亚型的HLA LOH比例最高而C3亚型的HLA LOH比例最低(图5B)。此外,HLA I类的拷贝数和基因表达水平之间没有相关性(图5C)。与患者生存水平的相关性分析表明,发生HLA LOH的HLA I类低表达患者的生存率较低,但是HLA I类高表达患者则没...
应用LOHHLA技术,发现40%的非小细胞肺癌(NSCLCs)中存在HLA LOH,并与较高的亚克隆新抗原负荷、APOBEC介导的突变、细胞杀伤活性的增强和PD-L1的阳性表达有关。HLA-LOH变异的局灶性、亚克隆频率、转移部位的富集和平行事件的发生提示,HLA-LOH是一种免疫逃逸机制,在肿瘤进化过程中受到强烈的微环境选择压力。用LOHHLA...
在肿瘤进化及治疗压力下肿瘤细胞HLA-I类基因出现杂合性缺失(LOH)。HLA-I LOH导致HLA多样性降低、HLA编码产物的表达下降,HLA识别新生抗原介导的免疫监视功能削弱,最终导致肿瘤细胞的免疫逃逸。为了解HLA-I LOH在肿瘤发生和治疗中的作用,...
此外,一些研究显示,肿瘤细胞可以通过甲基化降低HLA分子表达或通过突变引发HLA杂合性缺失(LOH),实现免疫逃逸。例如,Karchin R教授团队研究发现,近40%的肺腺癌患者会发生HLA-LOH,且HLA-LOH与较差的预后相关[5]。 即使APC细胞激活了CTL细胞,如果肿瘤细...
Chowell, D.et al在2017年首次报道了HLA-I的胚系基因型和体系LOH情况对ICI疗法反应的研究。该研究对超过1535名使用ICI治疗的癌症患者分析发现,在给定个体中更多样化HLA-I分子(即HLA-I杂合性)的存在与生存期的增加相关,这可能是由于这种多样性的存在能够向T细胞提供更广泛的肿瘤抗原。进一步研究发现,HLA-I杂合性...
为什么要分析HLA? 因为HLA呈现多态性(各个等位基因座是随机组合的,基因型可达1010以上,而共显性使人类HLA表型多样性达107数量级)的患者,能更多地获益于免疫检查点抑制剂治疗。反过来说,HLA杂合性缺失(HLA LOH),可导致抗原呈递障碍而发生“免疫逃逸”,从而导致免疫治疗耐药。
hla检测分为两个层面一个是患者胚系hla基因分型目的是看患者hla的多样性另外一个层面是看肿瘤细胞的hla基因是否因为免疫逃逸发生了杂合性缺失前者检测的是患者的正常细胞如血液白细胞提取的dna后者检测的是肿瘤组织提取的dnahla基因分型是hla杂合性缺失分析的基础 NSCLC免疫治疗预后biomarker:HLALOH阳性代表着什么?
先前研究中报道了HLA-I型基因在肿瘤细胞中会高频出现杂合性缺失(LOH),造成部分HLA等位基因的表达缺失。因此,该研究还分析了Cohort1肿瘤组织中的HLA-I类基因LOH情况。231名HLA-I杂合性患者中,有32人存在至少一处LOH。通过图7的生存分析看出,HLA-I型基因在肿瘤中一旦出现LOH,其ICB治疗后将会出现较差的生存情况。
基于HLA LOH克隆性分析,克隆性HLA LOH发生在肿瘤的早期阶段,可能导致肿瘤免疫治疗抵抗。M2中三个HLA-I等位基因HLA-A*24:02、HLA-B*57:01和HLA-C*06:02丢失,进一步导致了免疫治疗耐药(图3B)。为了更好地了解免疫治疗耐药的潜在机制,计算经HLA校正的TMB和ITH(瘤内异质性,亚克隆基因突变/所有基因突变) (图3C...
●作者开发了一种研究HLA LOH(loss of heterozygosity in human leukocyte antigen)的分析方法,并通过独立的两种方式进行了验证; ●利用该方法在肺癌数据集中分析发现,40%的NSCLCs样品中均存在HLA LOH现象; ●结果证实:HLA LOH是导致肿瘤免疫逃逸的主因之一。 LOHHLA算法及验证 LOHHLA算法 算法概述: 1、提取比对到...