传统的Sanger测序难以精准的解析低频突变、嵌合突变以及复杂突变,高昂的测序成本和分析时间限制了对多倍体、多样本或多位点突变的鉴定。目前二代测序是突变鉴定的重要手段,但其在基因编辑突变鉴定中的广泛应用,受限于其复杂的测序文库构建方法以及专业的生物信息学分析。为解决这一问题,中国农业科学院中国水稻研究所王克...
而面向普通生物学实验室开发的Hi-TOM方法只需两步普通PCR即可完成多样本混合测序文库构建,在得到测序数据后,只需要将测序数据上传至Hi-TOM在线分析网站(http://www.hi-tom.net/hi-tom/)就可以解析获得每个样品每个位点的详细突变序列以及对应的基因型信息。文章中以六倍体小麦、人类细胞和水稻样品为例,测试发现Hi-...
可以利用基因测序技术对差异部位进行测序分析,以确定其DNA序列是否发生了变化。如果发现差异部位的DNA序列与野生型植物不一致,那么可以确认它是基因编辑的突变体。 步骤五:基因编辑类型鉴定 在确定差异部位是基因编辑的突变体后,需要进一步鉴定其基因编辑类型。基因编辑技术有多种类型,包括CRISPR-Cas9、TALENs和ZFNs等。
Hi-TOM使用说明.PDF,Hi-TOM 使用说明 工作原理:利用两次普通 PCR 完成高通量测序文库的快速构建,并用Hi-TOM 在线网站自动解析出多样品多位点的详细变异信息,可灵敏检测包括基因编辑突 变在内的任何DNA 变异和详细基因型信息。 1、Hi-TOM 流程图 2 、Hi-TOM 试剂盒样品排
1 基因编辑突变及SNP检测之Hi-TOM说明书(V1.6) 刘庆,王春,焦晓真,王克剑 中国水稻研究所 2019年1月更新 一、工作原理 仅需两次普通PCR即可快速完成高通量测序文库的构建(图1),并用配套的Hi-TOM (http://.hi-tom.net/hi-tom/)在线工具自动解析高通量测序数据,理论每次可解析无限样品、无限位点, 检测包括SNP...
而面向普通生物学实验室开发的Hi-TOM方法只需两步普通PCR即可完成多样本混合测序文库构建,在得到测序数据后,只需要将测序数据上传至Hi-TOM在线分析网站(http://www.hi-tom.net/hi-tom/)就可以解析获得每个样品每个位点的详细突变序列以及对应的基因型信息。文章中以六倍体小麦、人类细胞和水稻样品为例,测试发现Hi...
而面向普通生物学实验室开发的Hi-TOM方法只需两步普通PCR即可完成多样本混合测序文库构建,在得到测序数据后,只需要将测序数据上传至Hi-TOM在线分析网站(http://www.hi-tom.net/hi-tom/)就可以解析获得每个样品每个位点的详细突变序列以及对应的基因型信息。文章中以六倍体小麦、人类细胞和水稻样品为例,测试发现Hi...
而面向普通生物学实验室开发的Hi-TOM方法只需两步普通PCR即可完成多样本混合测序文库构建,在得到测序数据后,只需要将测序数据上传至Hi-TOM在线分析网站(http://www.hi-tom.net/hi-tom/)就可以解析获得每个样品每个位点的详细突变序列以及对应的基因型信息。文章中以六倍体小麦、人类细胞和水稻样品为例,测试发现Hi...