hdzip顺式作用元件 HDZip顺式作用元件是植物特有的转录因子,属于HD-Zip家族。它们主要通过顺式作用调控植物的生长发育过程,如细胞分化、形态建成等。HD-Zip蛋白通常含有1-2个Homeobox结构域和一个Leucine zipper结构域,其中Homeobox结构域负责DNA结合,Leucinezipper结构域则参与蛋白的二聚化,两者协同作用来实现基因表达...
在大麻HD-Zip基因家族中,每个基因启动子区域都包含顺式元件,其中光响应元件数量最多(图5),其次是激素样顺式元件。对大麻HD-Zip基因家族成员在不同组织部位的表达模式的分析显示,有23个基因在花中高表达(图6)。 图5. CsHD-Zip基因中顺式作用元件的分布。21个顺式作用元件在33个CsHD-Zip启动子区域的分布。这...
[结论]通过苹果基因组扫描获得22个HD-Zip Ⅰ基因,这些基因编码的蛋白结构相似度较高;基因启动子区域含有多个参与不同激素交互作用的顺式作用元件,这或许为家族成员差异响应各外源激素处理的原因;MdHZ1和MdHZ17两个基因与果实的后熟进程表现出较为紧密的联系,可以作为候选基因进行果实后熟相关方面的深入研究。 展开 ...
【方法】利用生物信息学方法从陆地棉 TM-1 基因组中鉴定出 GhHDZ 基因家族成员,并对其理化特性,系统进化关系,染色体定位, 基因复制,基因结构和启动子区顺式作用元件等进行分析.利用转录组数据结合实时定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction, RT-qPCR)分析 GhHDZ 家族基因在不同非生物...
该基因位于马铃薯第1染色体, 其启动子区含有ABRE、LTRECOREATCOR15和WBOXATNPR1等多种响应非生物胁迫(ABA、低温、脱水和高盐)的顺式作用元件。ATHB12基因在马铃薯根、茎和叶中均有表达, 其根中表达量最高。qRT-PCR分析证实该基因的表达受聚乙二醇(PEG)、NaCl和ABA诱导, 受低温抑制。构建了由组成型表达启动子CaM...
该基因位于马铃薯第1染色体,其启动子区含有ABRE,LTRECOREATCOR15和WBOXATNPR1等多种响应非生物胁迫(ABA,低温,脱水和高盐)的顺式作用元件.ATHB12基因在马铃薯根,茎和叶中均有表达,其根中表达量最高.q RT-PCR分析证实该基因的表达受聚乙二醇(PEG),Na Cl和ABA诱导,受低温抑制.构建了由组成型表达启动子Ca MV ...
【方法】利用生物信息学方法从陆地棉TM-1基因组中鉴定出GhHDZ基因家族成员,并对其理化特性、系统进化关系、染色体定位、基因复制、基因结构和启动子区顺式作用元件等进行分析。利用转录组数据结合实时定量聚合酶链式反应(quantitative real-time polymerase chain reaction, RT-qPCR)分析GhHDZ家族基因在不同非生物胁迫下的...
据报道,HD-ZIP IV转录因子特异性识别并结合其下游靶基因启动子中的L1盒元件(TAAATGCA/-TAAATGTA)以在植物中发挥调节作用。我们分析了上述细胞壁松动蛋白基因的启动子区域,发现只有GhXTH2D和GhEXLB1D的启动子含有L1盒顺式元件(图3a)。 为了证实GhXTH2D和GhXLB1D是否是GhHOX4调控的靶基因,我们在大肠杆菌中表达了...
3螺旋、氨基末端可变臂和位于前两个 !3螺旋之间的环与&839:; 专一性地识别靶基因 $T上游区的顺式作用元件密切相关。 此外, &839:; 的 &8 羧基末端方向还紧密相连着 09 (图 2) ,这一点在动物和真菌中均未发现,暗示 &839:; 对于高等植物特有的发育进程有着重要意义[2, #]。 09 的特征是每隔 6 个...
研究结果可为进一步解析黄瓜 HD-ZIP 家族基因的生物学功能和作用 机理提供了一定的参考价值。关于这项研究主要结果如下: 1.从黄瓜基因组数据库中鉴定了40 个编码 HD-Zip 蛋白的 CsHDZ 基因,并将这些 基因依据染色体上的位置,命名为 CsHDZ1-CsHDZ40。CsHDZ 基因大部分位于细胞 核,而 CsHDZ05、CsHDZ11、CsH...