「单个位点缺失率统计:」 「基因型个体缺失率统计:」 4. 对个体及SNP缺失率进行筛选 1, 如果一个SNP在个体中2%都是缺失的,那么就删掉该SNP,参数为:--mind 0.02 2,如果一个个体,有2%的SNP都是缺失的,那么就删掉该个体,参数为:--geno 0.02 4. 1 对个体缺失率进行筛选 「先过滤个体缺失率高于2%的SNP」 ...
1, 如果一个SNP在个体中2%都是缺失的,那么就删掉该SNP,参数为:--geno 0.02 2,如果一个个体,有2%的SNP都是缺失的,那么就删掉该个体,参数为:--mind 0.02 4. 1 对SNP缺失率进行筛选--geno 「先过滤SNP缺失率高于2%的SNP」 plink --bfile HapMap_3_r3_1 --geno 0.02 --make-bed --out HapMap_3_...
4. 对个体及SNP缺失率进行筛选 1, 如果一个SNP在个体中2%都是缺失的,那么就删掉该SNP,参数为:--geno 0.02 2,如果一个个体,有2%的SNP都是缺失的,那么就删掉该个体,参数为:--mind 0.02 4. 1 对个体缺失率进行筛选 先过滤个体缺失率高于2%的SNP plink --bfile HapMap_3_r3_1 --geno 0.02 --make-bed...
1, 如果一个SNP在个体中2%都是缺失的,那么就删掉该SNP,参数为:--mind 0.02 2,如果一个个体,有2%的SNP都是缺失的,那么就删掉该个体,参数为:--geno 0.02 4. 1 对个体缺失率进行筛选 「先过滤个体缺失率高于2%的SNP」 plink --bfile HapMap_3_r3_1 --geno 0.02 --make-bed --out HapMap_3_r3_2 ...
1, 如果一个SNP在个体中2%都是缺失的,那么就删掉该SNP,参数为:--mind 0.02 2,如果一个个体,有2%的SNP都是缺失的,那么就删掉该个体,参数为:--geno 0.02 4. 1 对个体缺失率进行筛选 「先过滤个体缺失率高于2%的SNP」 plink --bfile HapMap_3_r3_1 --geno 0.02 --make-bed --out HapMap_3_r3_2...