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gene annotation analysis涉及到很多基因组学的工具和数据库,其中一些常用的工具包括:BLAST、Gene Ontology (GO)、Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG)等。BLAST是一种基于序列比对的工具,它可以将未知序列与已知序列比对,从而确定其可能的功能。例如,我们可以将一条未知的DNA序列与已知的基因组中的DNA序列...
2) genome annotation 基因组注释 例句>> 3) gene functional annotation 基因功能注释 1. Application of Improved K-means Clustering Phylogenetic Profile in Gene Functional Annotation; 基于改进K-means聚类的系统发育谱方法在基因功能注释中的应用 更多例句>> ...
基因注释,gene annotation 1)gene annotation基因注释 英文短句/例句 1.Using the Microarray Technology to Study on Differential Expressed Genes Annotation and Clone of Swainsonine (Swainsona Salsula Taub.) Roots under Salinity Stress芯片杂交用于对苦马豆幼根耐盐差异表达基因注释及克隆 2.A Gene Selection ...
WARNING: A total of 405 sequences will be ignored due to lack of correct ORF annotation 1. 2. 3. 4. 5. 会输出两个文件,后缀分别为.variant_function和.exonic_variant_function。 1. variant_function
Gene-based annotation ANNOVAR的一个功能是生成基于基因的注释。通过基因相关注释,可以知道变异位点在基因组上的位置和对蛋白质编码的影响。确定SNP或CNV是否会导致蛋白质编码变化和受影响的氨基酸。 可灵活使用RefSeq基因,UCSC基因,ENSEMBL基因,GENCODE基因,AceView基因或许多其他基因定义系统。
基于基因组区域的数据库注释(「Region-based annotation」),主要注释该异位于基因组的什么功能区域,如 transcription factor、exon、基因间区、UTR等; 基于过滤功能的数据库注释(「Filter-based annotation」),主要注释该变异是否出现在一些常见数据库中,如1000 Genome Project, NHLBI-ESP 6500 exomes or Exome Aggregat...
(a.k.a.annotationcategories),andconcept-geneconnections(a.k.a.annotations):the“Concept-and-GeneNetwork”andthe“Concept-and-GeneCrossTabulation”.Thesemethodshavebeentestedandvalidatedwithmicroarray-derivedgenelists.Conclusions:ThesenewvisualizationmethodscaneffectivelypresentannotationsusingGeneOntology,Disease...
ANNOVAR gene-based annotation 通过基因相关注释,可以知道变异位点在基因组上的位置和对蛋白质编码的影响。在进行注释之前,首先需要下载物种对应的数据库,以human为例,命令如下 annotate_variation.pl -downdb -buildver hg19 -webfrom annovar refGene humandb/...
Improving gene annotation of peanut genome by integrated proteogenomics workflow(通过整合的蛋白质组学工作流程改善花生基因组的基因注释)解读人:卜繁宇 期刊名:J. Proteome Res. 发表时间:2020年5月 IF:3.86 单位:广东省农业科学院 物种:花生 技术:蛋白质基因组学...