此技术基于肠道细菌基因组内广泛分布的 ERIC(肠杆菌基因间重复共有序列)序列,借由特异性引物扩增、杂交,高效区分不同细菌种类,产出高分辨率菌群结构信息,有力推动大熊猫肠道微生态研究从表象走向纵深,进而精准指导保育实践。二、ERIC-PCR 分子杂交技术原理 (一)ERIC 序列特性 ERIC 序列是细菌基因组特定重复元件,...
产生的 图谱多态性丰富 PCR反应的般原理 PCR:聚合酶链式反应,即通过引物延伸核酸的某 个区域而进行的重复双向DNA合成.基本要素:•DNA模板•对寡聚DNA引物(启动DNA扩增)•TaqDNA聚合酶(催化DNA合成)•缓冲液(提供DNA合成所需pH、离子强度等环境)•dNTP(DNA合成的原料)PCR原理 ERIC-PCR程序 ...
3 ERIC-PCR的原理及特点 在1999年,Franklin等和Wikstrom等分别报道了将短引物的RAPD技术应用到研究复杂的自然界微生物群落结构的动态检测上。但此技术存在很多问题,如引物太短,退火温度过低,不易获得稳定的图谱,重复性不理想,缺乏标准化。ERIC-PCR是在随机引物PCR(RAPD)的基础上发展起来的对细菌DNA进行指纹图谱分析的...
ERIC-PCR的原理是利用根据ERIC核心序列设计的反向引物进行PCR扩增,扩增产物大小在50~3000bp之间,根据所得数目不等、大小不同的各自独特的电泳带型来达到菌株鉴定的目的。 Versalovic等以ERIC的核心序列设计了一对反向引物(ERIC1:5′-ATGTA-AGCTCCTGGGATTCAC-3′,ERIC2:5′-AAGTAAGTGACTGGGGTGAGCG-3′)由于不...
3 ERIC-PCR的原理及特点 在1999年,Franklin等和Wikstrom等分别报道了将短引物的RAPD技术应用到 研究复杂的自然界微生物群落结构的动态检测上。但此技术存在很多问题,如引 物太短,退火温度过低,不易获得稳定的图谱,重复性不理想,缺乏标准化。ERIC- PCR是在随机引物PCR(RAPD)的基础上发展起来的对细菌DNA进行指纹图谱...
因其引物较长(22bp 寡聚核苷酸片段),退火温度较高(大于52e ),可产生具有较高可重复性和一定特异性的指纹图谱。因此,认为ER I C 2PCR 是一种半随机性质的PCR 。2 ER IC 2PCR 应用原理 由于ER IC 2PCR 可以扩增出反映微生物基因组结构特征 845 中国微生态学杂志 2010年9月第22卷第9期 ...
产生的 .图谱多态性丰富 PCR反应的一般原理 PCR:聚合酶链式反应,即通过引物延伸核酸的某 个区域而进行的重复双向DNA合成。基本要素:•DNA模板•一对寡聚DNA引物(启动DNA扩增)•TaqDNA聚合酶(催化DNA合成)•缓冲液(提供DNA合成所需pH、离子强度等环境)•dNTP(DNA合成的原料)PCR原理 .
对底物的序列差异敏感性高,产生的 图谱多态性丰富 PCR反应的一般原理 PCR:聚合酶链式反应,即通过引物延伸核酸的某 个区域而进行的重复双向DNA合成.基本要素:•DNA模板•一对寡聚DNA引物启动DNA扩增•TaqDNA聚合酶催化DNA合成•缓冲液提供DNA合成所需pH、离子强度等环境 •dNTPDNA合成的原料 PCR原理 ...
3 ERIC-PCR的原理及特点 在1999年,Franklin等和Wikstrom等分别报道了将短引物的RAPD技术应用到研究复杂的自然界微生物群落结构的动态检测上。但此技术存在很多问题,如引物太短,退火温度过低,不易获得稳定的图谱,重复性不理想,缺乏标准化。ERIC-PCR是在随机引物PCR(RAPD)的基础上发展起来的对细菌DNA进行指纹图谱分析的...