1从宏转录组研究的文章中找到DDBJ DRA编号,例如: 2打开DDBJ数据库,点击进入Sequence Read Archive (DRA)。 3点击进入Search。 4在Accession中输入DRA编号(例如:DRA006303),点击Search。 5点击进入FASTQ目录,右键鼠标获取DRR110568_1.fastq.bz2和DRR110568_2.fastq.bz2的下载链接。 6在linux环境中下载,解压fastq文件。
方法一:进入DDBJ寻找任意感兴趣的组学数据(不做介绍)。 方法二:根据文章中提供的DDBJ DRA编号进行数据检索和下载,过程如下: 第一步 在宏转录组相关研究的文章中的Data availability处找到metatranscriptome data的DDBJ DRA编号,例如: 第二步 打开DDBJ数据库,点击进入Sequence Read Archive (DRA)。 第三步 点击进入Sea...
除了这些基础工具,DDBJ还提供了一些高级工具。例如,其MiGAP工具可以用于微生物基因组的注释,而其DRA工具则可以用于提交和查找测序数据。 四、DDBJ的应用 DDBJ的数据和工具在生物学研究中有广泛的应用。科学家可以使用DDBJ的数据来研究基因的功能和演化,也可以利用其工具来分析自己的序列数据。 例如,科学家可以通过比对...
DRA提交系统进行了改进,允许多个实验和运行对象作为一个制表符分隔的文本文件提交。 2.3日本基因型与表型档案 JGA是人类个体的基因型与表型数据的永久存档服务。JGA数据收集根据授权协议进行,其授权数据发布仅针对特定的研究用途。JGA日本科学技术振兴机构(NBDC)的国家生物科学数据库中心协同提供此服务。JGA数据的存储、...
DDBJ continues to serve the biological science with the primary archive databases of DDBJ, DRA and DOR.doi:10.1038/npre.2010.5085.1Yuichi KodamaSatoshi SaruhashiEli KaminumaHideaki SugawaraYasukazu NakamuraOAINature Precedings
The expert annotators of DRA issue original accession numbers for submitted data. Concurrently, we developed the preliminary version of raw read annotation pipeline tool called DDBJ Read Annotation Pipeline. This analytical pipeline tool supports reference genome mapping, de novo assembly and further ...
日本DNA数据库有关人类遗传与表型数据的基因型与表型档案摘要:日本DNA数据库中心(DDBJ)对生物信息保持并提供公共的存档、检索和分析服务。自从2013年10月,日本DNA数据库中心已经与我们的伙伴研究所日本科学技术振兴机构(NBDC)的国家生物科学数据库中心合作操作管理日本基因型与表型档案(JGA)。日本基因型与表型档案室能安...
日本DNA数据库有关人类遗传与 表型数据的基因型与表型档案 摘要:日本DNA数据库中心(DDBJ)对生物信息保持并提供公共的存档、检索和分析服务。自从2013年10月,日本DNA数据库中心已经与我们的伙伴研究所日本科学技术振兴机构(NBDC)的国家生物科学数据库中心合作操作管理日本基因型与表型档案(JGA)。日本基因型与表型档案室能...
日本DNAデー夕バンク(DDBJ)では. DDBJ Cloudと呼ぶ大量塩基配列を扱うためのクラウドIM境の整備を進めており,次世代シーク工ンサー出力配列のアー力イブデー夕べースDRA (DDBJ Sequence Read Archive)と解析ッールDDBJPipelineを提供している.本稿では,DRA 5 DDBJ Pipelineの説明とともに.研究者が利用...
在宏转录组相关研究的文章中的Data availability处找到metatranscriptome data的DDBJ DRA编号,例如: 2.1.png 2.2.png 2. 第二步: 打开DDBJ数据库,点击进入Sequence Read Archive (DRA)。 3.png 3. 第三步: 点击进入Search。 4.png 4. 第四步: 在Accession中输入DRA编号(例如:DRA006303),点击Search。