如只关心ctaC蛋白(即degree最高的那个node)以及与ctaC蛋白有互作关系的蛋白所形成的网络图:我们可以先鼠标左键选中ctaC蛋白,然后 最后 总结一下,这种使用Cytoscape快速展示String蛋白数据库的互作网络图的方法只需要三个步骤即可:1.导入数据;2.将degree等值赋予图形参数(node大小颜色等);3.修改图形参数。 以上介绍的为...
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最后点击File -> New -> Network ->From selected nodes即可形成一张局部互作网络图,如下图所示: 总结一下,这种使用Cytoscape快速展示String蛋白数据库的互作网络图的方法只需要三个步骤即可:1.导入数据;2.将degree等值赋予图形参数(node大小颜色等);3.修改图形参数。 以上介绍的为展示String互作网络图的一种简单的...
总结一下,这种使用Cytoscape快速展示String蛋白数据库的互作网络图的方法只需要三个步骤即可:1.导入数据;2.将degree等值赋予图形参数(node大小颜色等);3.修改图形参数。 以上介绍的为展示String互作网络图的一种简单的方法,我们为了让互作网络展示更多的信息,还可以将每个蛋白的foldchange信息以及P.value信息加入其中,以...
PPI网络:蛋白互作网络的构建与核心基因的筛选(string数据库,cytoscape软件与cytoNCA插件) 春秋至-生信碱移 19.3万 344 03:00 将WGCNA结果导入cytoscape制图 丰草书屋 2488 0 1:46:15 Cytoscape绘制网络图基础课程 生活就是造造造 4.3万 63 03:09 cytoscape3.7.2一键安装,cy3d、CentiScaPe、cytoHubba、mc...
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