图1 利用CRISPR-Cas9全基因组敲除筛选鉴定NSC活化的调控基因 为了验证基因敲除是否能够在体内增强NSC功能,作者开发了一种基于CRISPR-Cas9技术的体内筛选平台,用于识别能够增强衰老小鼠NSC功能的基因敲除。研究通过向老年小鼠的侧脑室中注射表达sgRNA的...
基于Cas9诸多优势,全球各个实验室利用Cas9技术在多种细胞系及各种模式动物上进行实验,成果显著。然而,单纯的设计一条或多条sgRNA(single guide RNA)进行基因敲低,这样的实验方法通量过低,因此,借鉴shRNA Screen技术,许多团队开发出版本各异的Cas9 Screen技术。 我查询到的最早版本的Cas9 screen来自两篇背靠背Science pap...
图1 利用CRISPR-Cas9全基因组敲除筛选鉴定NSC活化的调控基因 为了验证基因敲除是否能够在体内增强NSC功能,作者开发了一种基于CRISPR-Cas9技术的体内筛选平台,用于识别能够增强衰老小鼠NSC功能的基因敲除。研究通过向老年小鼠的侧脑室中注射表达sgRNA的慢病毒,感染位于SVZ区域内的NSC,5周后NSC活化导致敲除的病毒感染细胞迁移...
Sun BK. A genome-wide long noncoding RNA CRISPRi screen identifies PRANCR as a novel regulator ...
2、文章题目:A genome-wide CRISPR/Cas9 knockout screen identifies SEMA3F gene for resistance to cyclin-dependent kinase 4 and 6 inhibitors in breast cancer 期刊:SpringerLink(IF:4.0) Palbociclib,一种小分子细胞周期抑制剂,常与内分泌治疗联合应用于HR阳性、HER2阴性的晚期乳腺癌患者,已成为标准治疗手段之一...
图2 CRISPR-Cas Screen筛选后测序检测和分析模式图 提取相应细胞基因组并使用特异性引物PCR出整合的sgRNA序列后构建二代测序文库测序,再通过生物信息学分析样品中gRNA丰度,丰度变化的gRNA所对应的lncRNA便是调控筛选条件过程的潜在分子靶标。如此得到的靶标...
2、文章题目：A genome-wide CRISPR/Cas9 knockout screen identifies SEMA3F gene for resistance to cyclin-dependent kinase 4 and 6 inhibitors in breast cancer 期刊：SpringerLink（IF：4.0）Palbociclib 是一种针对细胞周期的小分子药物，与内分泌疗法联合使用，是激素受体 (HR) 阳性、人类表皮生长因子受体 2...
2023年7月,由Stine L. Hansen为第一作者在《SCIENCE ADVANCES》杂志发表题为《An organoid-based CRISPR-Cas9 screen for regulators of intestinal epithelial maturation and cell fate》的文章,该文章首次利用CRISPR-Cas9技术筛选出基因Smarca4和Smarcc1。确定了编码SWI/SNF复合物成分的基因Smarca4和Smarcc1是上皮成熟的...
2023年7月,由Stine L. Hansen为第一作者在《SCIENCE ADVANCES》杂志发表题为《An organoid-based CRISPR-Cas9 screen for regulators of intestinal epithelial maturation and cell fate》的文章,该文章首次利用CRISPR-Cas9技术筛选出基因Smarca4和Smarcc1。确定了编码SWI/SNF复合物成分的基因Smarca4和Smarcc1是上皮成熟的...
图2 CRISPR-Cas Screen筛选后测序检测和分析模式图 提取相应细胞基因组并使用特异性引物PCR出整合的sgRNA序列后构建二代测序文库测序,再通过生物信息学分析样品中gRNA丰度,丰度变化的gRNA所对应的lncRNA便是调控筛选条件过程的潜在分子靶标。如此得到的靶标均是在癌症发生过程中有调节功能的lncRNA,在经过分析和筛选后部...