例如,如果你想安装ggplot2这个R包,你应该在命令行中输入: bash conda install -c r r-ggplot2 执行命令进行安装: 按下回车键执行上述命令,Conda将会开始下载并安装指定的R包及其依赖项。 验证R包是否安装成功: 安装完成后,你可以启动R会话(在命令行中输入R),然后在R的提示符下尝试加载该包来验证是否安装成功...
现在,您已经成功地在远程服务器上通过Conda安装了R环境。您可以根据需要在这个环境中安装其他R包或工具。例如,如果您需要安装一个名为’ggplot2’的包,您可以使用以下命令: conda install -c conda-forge ggplot2 完成所有操作后,别忘了退出Conda环境: conda deactivate 现在您已经成功地在远程服务器上通过Conda安装...
R包安装通常会遇到当前channel找不到R包的情况,这时可以使用anoconda进行搜索对应R包的channel;如果还是没有合适的,可以尝试运行R程序,使用install.package()或者BiocInstaller::biocLite("")直接安装该R包。 1.source activate R3.52.conda install r-ggplot2#R包通常需要以r-开头3.anaconda search-t conda r-ggpl...
在Conda中安装R库可以通过以下步骤完成: 1. 打开终端或命令提示符窗口。 2. 创建一个新的Conda环境(可选)。如果你想在一个独立的环境中安装R库,可以使用以下命令创建一个新的环境: ...
安装时指定版本减少搜索空间conda install python=3.7.4 安装R包时指定R的版本也会极大减小搜索空间 (R包因其数目众多,也是生物类软件依赖解析较慢的原因之一)conda install r-base=4.0.2 r-ggplot2=3.3.2 采用mamba加速软件依赖解析 [mamba采用c++重写了部分解析过程,这个提速效果是很明显的] (安装好mamba后就...
安装特定版本的软件: conda install 软件名=版本号 conda install -c conda-forge r-base=4.3.3 安装R的packages: conda install -c r r-dplyr conda install r-ggplot2 conda install -c bioconda bioconductor-deseq2 conda install --channel https://conda.anaconda.org/BioBuilds r-ggplot2 ...
另外就是,大家在安装它的时候,它没办法很好的自动解决它自己的依赖问题,所以官网给了其系列依赖包的独立安装方式。 首先是在cran的 代码如下所示: CRANdep <- c("Seurat","reticulate","R.utils","dplyr","ggplot2","clustree","ape","gtools", ...
要装的R包可以在conda上搜索:https://anaconda.org/search?q=DESeq2 conda install -c bioconda bioconductor-deseq2 如果想要安装Github上的R包,需要自己手动在conda创建这个安装包 (要有一个conda的账号) conda skeleton cran <github_url> conda build --R=<my_r_version> r-<lower-case-package-name>...
另外就是,大家在安装它的时候,它没办法很好的自动解决它自己的依赖问题,所以官网给了其系列依赖包的独立安装方式。 首先是在cran的 代码如下所示: 代码语言:javascript 复制 CRANdep<-c("Seurat","reticulate","R.utils","dplyr","ggplot2","clustree","ape","gtools","future","grid","gridExtra","magri...
conda install <package name> # 安装软件包 # -y是同意安装,不写的话会弹出提示,需要再次确认 conda install numpy=1.7.2 -y # 安装特定版本的软件包 conda remove <package name> # 移除软件包 安装R 更新包 # 更新基础conda,新版本conda使用起来更快 ...