circRNA Disease数据库可以通过circRNA、host gene、disease这三种方式检索。 具体的circRNA记录包括circRNA基础信息项,相关疾病信息,PubMed链接。circRNA的ID号也做了circBase的链接,可以直接前往circBase数据库。 接下来,BioWorld以disease检索为例,看一下数据库的使用情况 数据库使用和检索界面非常简洁方便,无需教程即可直...
该数据库整合了circBase和ENCODE两个数据库信息,以及其中ChIP-seq、RNA-seq,还有450K甲基化芯片的数据集,可以研究和分析多种细胞的circRNAs转录调控信息。 在这里,如果circRNA的调控区域内至少对应转录因子的一个结合峰,那么就认为其能被这个转录因子调控。这里的circRNA的调控区域包含了转录起始位点的上游2000bp,以及下...
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