易基因 -【第17期】染色质免疫共沉淀（ChIP-seq）应用实例分析（表观调控1571 播放 · 4 赞同视频 ...
ChIP-seq ChIP全称:染色质免疫共沉淀(Chromatin immunoprecipitation ,ChIP),seq表示测序。 原理:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地将目的蛋白及其结合的DNA片段一起拉下来,并对DNA进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。再将获得的数百万条序列精确定位到基因组上,从而获得全基因组范围...
ChIP-seq，全称为Chromatin Immunoprecipitation followed by Sequencing（染色质免疫沉淀后测序），是一项强大的实验技术，旨在揭示细胞内的基因调控机制。当我们在ChIP-seq分析中发现peaks时，它就像是一个地图上的显著标记，指示着特定蛋白质（如转录因子或调控因子）与DNA序列的热点互动区域。Peaks实质上代表...
ChIP），是一种用来在体内鉴定及分析基因组内部蛋白质-DNA 相互作用的有力研究技术。
ChIP全称为Chromatin immunoprecipitation,中文名称染色质免疫沉淀技术,该技术可解析活细胞状态下蛋白与DNA的结合情况。而蛋白质通过与DNA进行结合,进而调节基因表达,正是表观遗传学的重点研究对象之一。 单细胞ChIP-seq技术可以从单细胞层面上让我们解析,为何不同细胞中基因的表达会出现差异,产生差异的上游调控机制是如何形...
ChIP全称是染色质免疫共沉淀,就是用抗体吊取用甲醛交联过的染色质中的特异转录因子或者发生修饰的组蛋白,然后,用磁珠,琼脂糖珠,或者抗体包被板等策略将转录因子或组蛋白上交联上的DNA洗脱下来,然后去测序。说起来很简单,但是,这里边有很多“坑”,我们一一细数一下。
全称是:DNA腺嘌呤甲基转移酶鉴定 DNA adenine methyltransferase identification,是一种不需要抗体、固定或pull-down的全基因组蛋白-DNA相互作用的鉴定方法。 DamID利用E coli的腺嘌呤甲基转移酶(Dam)去融合目标蛋白。当这个目标蛋白可以结合染色质的时候,那么这个染色质上结合的DNA上的(GATC序列)A会被甲基化。会有一个...
KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)全称是京都基因与基因组大百科全书,是系统分析基因(及其编码产物)间关系、基因功能、基因组信息的数据库,它有助于研究者把基因及表达信息作为一个整体网络进行研究。基因组信息存储在Genes数据库里,包括完整和部分测序的基因组序列;更高级的功能信息存储在Pathway 数据库里...
这两年最火红的技术应该是CUT&RUN,全称为cleavage under targets and release using nuclease,由美国Fred Hutchinson癌症研究中心的Steven Henikoff团队开发。从2017年问世至今,目前已有多篇高影响因子的文章发表。 这项技术的主要特点是,它可以在完整的细胞或细胞核上进行,无需甲醛固定或超声处理。细胞经过透化处理(扩孔...