ChIP-seq,测序方法 ChIP 指染色质免疫共沉淀技术(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP), seq 指的是二代测序方法 作用:识别蛋白质与DNA互相作用情况 原理:染色质免疫共沉淀 + 二代测序 应用:常用于转录因子结合位点和组蛋白修饰位点的研究 二、测序原理 1、使用甲醛将目标蛋白与染色质交联固定起来 2、从细胞裂解液分...
ChIP-seq组蛋白特异性修饰位点?常见问题 1. Input和IP样本之间的关系是什么? Input和IP属于两个样本,在前期检测、建库、测序都是平行进行的,但是分析中需要将两个样本的测序数据进行整合分析,得出终的peak结果,并进行后续分析。 2. Input是什么?有什么作用?
染色质免疫沉淀测序 (ChIP-Seq)是一种强大的工具,使研究人员能够研究和了解蛋白质-DNA 相互作用以及它们对基因表达和细胞功能的影响。 ChIP-Seq 分析结合染色质免疫沉淀 (ChIP) 测定和下一代测序 (Seq) 来识别整个基因组中转录因子和其他蛋白质的 DNA 结合位点。 该技术为研究人员提供了对健康状态和各种疾病中发...
对于上面的这些结果，具体解析如下：作者首先利用质谱鉴定了lys36是新的乙酰化位点，接着为了验证和扩展质谱结果，作者利用PAGE分离拟南芥花序组蛋白提取物，并用抗H3K36ac的抗体进行探针检测。该抗体之前使用修饰和未修饰的多肽进行了斑点印迹和蛋白质免疫印迹的特异性测试，并通过ChIP-seq进行了验证(Morris et al., ...
2.ChIP-Seq的实验步骤有哪些？①使用甲醛将目标蛋白（组蛋白、转录因子等）与染色质交联固定；②从细胞...
1、确定转录因子在整个基因组上的结合位点，进一步分析结合位点的保守motif；2、确定转录因子调控的下游基因。Histone ChIP-seq适用场景：1、确定全基因组区域内组蛋白修饰位点情况；2、检测同一种组蛋白修饰在不同实验处理或不同发育时期的修饰差异，再结合转录组数据，考察该种组蛋白修饰对基因表达的调控作用；3、...
染色质免疫沉淀反应后测序(ChIP-seq)是表观基因组研究的核心方法,它可以检测整个基因组中的蛋白质/DNA结合和组蛋白修饰位点。组蛋白修饰的全基因组分析,如增强子分析和全基因组染色质状态注释,可以系统地分析表观基因组景观如何有助于细胞身份,发育,谱系规范和疾病。测序技术和...
包括交联、细胞裂解（蛋白质-DNA提取）、核酸剪切、抗体免疫沉淀、DNA样本回收，将蛋白-DNA复合物分离出来进一步研究特定的结合蛋白或与其结合的DNA，同时结合qPCR（ChIP-qPCR）可用于检测已知蛋白与特定结合位点的DNA是否结合以及结合的强度，结合二代测序（ChIP-seq）可用于分析目标蛋白在全基因组内的结合情况，用于下游...