为了提升大模型能力，算法团队将所有任务的数据集进行了扩充，将CBLUE的16000条数据应用到8个重点测评任务中，包括CHIP-CDEE（临床发现事件抽取）、CMeEE-V2（中文医学命名实体识别）、CHIP-CDN（临床术语标准化）、CMeIE-V2（中文医学文本实体关系抽取）、IMCS-V2-NER（智能对话诊疗数据集NER抽取）、CHIP-MDCFNPC（...
对CHIP-CDN任务,采用基于ICD-10标准词实例层面的严格的(strict),micro的precision, recall, F1分数。这里的ICD-10标准词实例包含mention和阴阳性判断标签字段。 对于CMedCasual任务,采用基于因果三元组实例层面的严格的(strict),micro的precision, recall, F1分数。 对于Text2DT,我们采用基于决策树编辑比率的评价指标。
ChIP-seq是一种结合位点分析法,用于研究体内蛋白质与DNA相互作用。通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)与第二代测序技术相结合,在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区域。 实验过程 流程简介 1. fastp:原始数据质控,将 Raw data 转换成 Clean data。 2. bowtie2:将经过质控的 Clean data 比对到参考...
为了提升大模型能力,算法团队将所有任务的数据集进行了扩充,将CBLUE的16000条数据应用到8个重点测评任务中,包括CHIP-CDEE(临床发现事件抽取)、CMeEE-V2(中文医学命名实体识别)、CHIP-CDN(临床术语标准化)、CMeIE-V2(中文医学文本实体关系抽取)、IMCS-V2-NER(智能对话诊疗数据集NER抽取)、CHIP-MDCFNPC(医疗对话临床...
ChIP-seq的数据是以read的方式存储的。一个数据集大约翰几百万个read。对于ChIP-seq数据的分析主要应用到包GAlignments,这个包要调用python下的Bioconductor 至于怎么用这个包将Raw数据转化成可以操作的read我在今后会分享给大家,如果感兴趣的也可以一些生物信息学论坛找人交流。
上海齐济电子有限公司 (Chipgem) 主要从事单片机 (MCU)、集成电路 (IC) 及其相关的电子元器件分销,同时提供定制化的产品应用方案和技术支持服务
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对CHIP-CDN任务,采用基于ICD-10标准词实例层面的严格的(strict),micro的precision, recall, F1分数。这里的ICD-10标准词实例包含mention和阴阳性判断标签字段。 对于CMedCasual任务,采用基于因果三元组实例层面的严格的(strict),micro的precision, recall, F1分数。 对于Text2DT,我们采用基于决策树编辑比率的评价指标。
对CHIP-CDN任务,采用基于ICD-10标准词实例层面的严格的(strict),micro的precision, recall, F1分数。这里的ICD-10标准词实例包含mention和阴阳性判断标签字段。 对于CMedCasual任务,采用基于因果三元组实例层面的严格的(strict),micro的precision, recall, F1分数。 对于Text2DT,我们采用基于决策树编辑比率的评价指标。
ChIP-GPT的开发目标是提高从生物医学数据库中提取ChIP目标和细胞系信息的准确性。通过在具有代表性的数据集上进行广泛测试,ChIP-GPT展现出了卓越的性能。在100个样本的评估中,该模型在ChIP目标识别任务上达到了90%-94%的准确率。细胞系识别方面,准确率同样保持在90%以上。这一结果明显优于传统数据提取工具,证明了Ch...