5.通过 qPCR 对 ChIP 结果进行验证。 6.准备好的 ChIP 后的 DNA 样品可以用于 ChIP Sequencing 建库。 2 ChIP免疫沉淀生物信息分析流程 由Illumina测序产生的数据通过质量控制以及过滤,借助比对工具与参考基因组比对。提取比对上唯一位置的序列,结果以bed文件存放,用bed文件做后续信息分析,包括read的分析和peak扫描。...
ChIP-Seq原理是:首先通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,并对其进行纯化与文库构建;然后对富集得到的DNA片段进行高通量测序。 DNA与组蛋白结合后形成核小体,核小体再进一步折叠压缩后最终形成染色质。DNA的复制和转录都需要将染色质紧密结构打开,从而允许调控因子结合DNA。这部分被打开的...
通过染色质免疫共沉淀技术(ChIP)特异性地富集目的蛋白结合的DNA片段,然后对这些DNA片段进行进行高通量测序,最后定位基因组信息,从而获得全基因组范围内组蛋白DNA及染色质修饰等DNA区段信息。 测序流程 通过甲醛使靶蛋白与染色质上目标区域的DNA交联结合,分离染色体,并用超声或酶处理将其打断成小片段(一般200-600bp)。
ATAC-Seq、ChIP-Seq、Dnase-Seq、MNase-Seq、FAIRE-Seq整体的分析思路一致,找到富集区域,对富集区域进行功能分析。 ChIP-Seq是揭示特定转录因子或蛋白复合物的结合区域,实际是研究DNA和蛋白质的相互作用,利用抗体将蛋白质和DNA一起富集,并对富集到的DNA进行测序。 DNase-Seq、ATAC-Seq、FAIRE-Seq都是用来研究开放染...
一般的ChIP－seq都需要百万的细胞数量，而ULI-NchIP是可以用极少量细胞进行ChIP-seq的新技术。@易基因...
基因芯片的测序原理 基因芯片又称为DNA微阵列(DNA microarray),可分为三种主要类型: 1)固定在聚合物基片(尼龙膜,硝酸纤维膜等)表面上的核酸探针或cDNA片段,通常用同位素标记的靶基因与其杂交,通过放射显影技术进行检测。这种方法的优点是所需检测设备与目前分子生物学所用的放射显影技术相一致,相对比较成熟。但芯片...
基因测序原理 基因测序是一种新型基因检测技术,能够从血液或唾液中分析测定基因全序列,预测罹患多种疾病的可能性,如癌症或白血病。 基因测序相关产品和技术已由实验室研究演变到临床使用,目前在众多保健及医疗机构和体检中心,都打出基因测序的广告,但其使用的基因测序仪及相关诊断试剂和软件,很多没有经过医疗器械的注册...
MobiNova®-S1高通量单细胞分选系统技术原理 MobiNova®-S1高通量单细胞分选系统主要通过微流控芯片生成皮升级油包水反应液滴,然后通过识别液滴中的荧光信号,利用介电泳使液滴偏转至不同流道,从而高效实现细胞分选。分选速度达1500HZ,单次分选通量高达百万级单细胞,分选准确度高达98%,分选后细胞活率高达95%。
将ChIP与高通量测序技术相结合的ChIP-Seq技术,可在全基因组范围对特定蛋白的DNA结合位点进行高效而准确的筛选与鉴定,为研究的深入开展打下基础。 DNA与蛋白质的相互作用与基因的转录、染色质的空间构型和构象密切相关。运用组蛋白特定修饰的特异性抗体或DNA结合蛋白或转录因子特异性抗体富集与其结合的DNA片段,并进行...