KEGG通路富集分析结果如附图10所示:在LPS刺激下,当敲低Jurkat细胞中的NUFIP1表达后,多种病原体感染(耶尔森氏菌、志贺氏菌、沙门氏菌、大肠杆菌、冠状病毒)信号通路、内质网中的蛋白质加工信号通路、氨基酸生物合成信号通路、自噬信号通路、细胞凋亡信号通路、坏死性凋亡信号通路、cGAS-STING信号通路、P53信号通路、Ra...
结合GO,KEGG富集分析得到阳和汤可能通过调控AGE-RAGE信号通路,胞浆DNA传感通路(cGAS-sting通路),HIF-1,TNF等信号通路减轻炎症反应,调节自噬,氧代谢,免疫反应等多种方式来达到治疗脊柱结核的作用;分子对接提示阳和汤中的槲皮素,亚麻酸等活性成分能够与IL-6,TNF-α,IL-1β较好的结合.小结:阳和汤可能通过多靶点,多...
在人类基因综合数据库Gene Card网站获取cGAS-STING信号通路相关基因.2,通过GO(GO Enrichment Analysis)和KEGG(京都基因和基因组百科全书)富集分析明确cGAS-STING信号通路在肺腺癌和癌旁组织中的富集程度.3,单因素COX回归和生存曲线分析筛选肺腺癌预后相关基因;多因素COX回归构建cGAS-STING信号通路相关基因的预后模型,形成...
(3)通过Microarray analysis检测基因表达水平,利用KEGG term明确PCBP2在胶质瘤中作用的重要靶点,利用Western blot,q RT-PCR检测STING,c GAS和PCBP2的蛋白和m RNA表达,研究PCBP2对c GAS/STING信号通路的作用;通过Co-IP,免疫荧光及Western blot探究PCBP2和c GAS蛋白之间的关联.(4)通过m6A甲基化序列分析检测PCBP2...
利用公共数据库分析TRIM38高表达的胶质母细胞瘤样本中相关通路的富集情况;采用RNA测序检测TRIM38表达对胶质母细胞瘤转录组的影响;对差异表达基因进行生物信息学分析,包括基因本体论GO(Gene Ontology,GO)富集分析和KEGG(Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析;利用Western blot验证U251和A172细胞系中相关...
KEGG富集分析显示Th1,Th2,Th17细胞的分化,NF-k B信号通路,抗原处理与呈递等皆受到显著影响.琼脂糖凝胶电泳实验结果显示,HES-SS-CH与si RNA的质量比为60:1时,si RNA被纳米载体包载的效果最佳.游离HES-SS-CH与si RNA@HES-SS-CH的纳米粒径分别为176.1nm和174.8nm,聚合物分散系数(PDI)为0.209和0.204,表面电荷...
随后用GO,KEGG,COG,Pfam和亚细胞定位等方式对差异蛋白进行了功能注释和富集分析.GO和KEGG富集分析显示宿主细胞表达差异蛋白相关的途径均涉及先天免疫系统胞质DNA识别通路(Cytosolic DNA-sensing pathway),可能包括c GAS-STING通路.同时通过RT-q PCR验证蛋白组数据的可靠性,结果发现PACSIN2,USPL1,ATXN10,ZNF507及SNX9...
进而通过Seq-RNA分析UL41对IFN-β激活通路的影响,从差异基因表达,差异基因GO富集及KEGG通路富集分析UL41对IFN通路相关分子的调控.结果表明UL41可显著下调cGAS,STING和Viperin的表达.Western blot分析UL41可显著抑制cGAS,STING和Viperin的过表达,可促进BHV-1感染状态下和IFN-β激活的Mx1蛋白表达,抑制IFN-β诱导的...