这类常见MOF的cif源文件下载渠道有很多,比如COD(Crystallography Open Database)数据库,IRMOF-1对应的ID为4326737。在搜索框中输入后点击Search即可。 搜索结果如下,直接点击CIF的link即可下载。 用Diamond打开后如下图所示,可以先Destroy all,然后Fill Unit Cell得到单个...
•所需背景：1、MOF材料的晶体结构；2、被吸附分子坐标•晶体结构预处理：将cif文件导入MS中，删除客体分子，检查结构是否有无序，若有，先删去其中占有率偏小的一套坐标，如若单胞的原子个数较少（<500个，依据计算资源而定），可以将此坐标进行DFT优化。•被吸附分子建立：可直接通过MS对小分子建模，或...
具体操作步骤如下: 导入MOF-5.cif文件: 从晶体学数据库下载MOF-5的CIF文件(点击文末“阅读原文”就可下载cif文件)。打开Diamond,根据导引打开MOF-5。注意:在导引中,可以选择自动创建晶体模型,也可以选择创建空白文件,如下图3所示(如果选择的是自动创建晶体模型,在后面构建模...