原始C-inde=0.472/2+0.5=0.736, 经bootstrap校正后的C-index=0.4348/2+0.5=0.719 分享更多R语言知识,请关注公众号【数据统计和机器学习】。后台回复“C-index”免费索取代码。如果对您有帮助请【分享+点赞+在看】 参考资料 blog.csdn.net/fjsd155/a ...
关于交叉验证(Cross-validation),如5-fold、10-fold等。 虽然看起来很复杂,但是事实上已经有人做了这些事情,在R中有包可以直接计算一致性指数:Hmisc 、compareC,两个包都可以计算c-index 今天就用一个例子来说明一下,数据准备: 表达谱矩阵: 生存时间和死亡事件 具体代码如下: 利用R软件计算临床预测模型评价指标-...
在R语言中,C-index(Concordance Index,一致性指数)通常用于评估生存分析模型的预测准确性,特别是在Cox比例风险模型中。C-index衡量的是预测的风险排序与实际生存时间排序之间的一致性。C-index的值范围在0到1之间,值越高表示模型的预测能力越强。 1. 理解C-index的定义和用途 C-index衡量的是模型预测的风险排序与...
(1)C-index计算两种方法: 方法1:直接从survival包的函数coxph结果中输出,需要R的版本高于2.15.需要提前安装survival包可以看出这种方法输出了C-index (对应模型参数C),也输出了标准误,95%可信区间就可以通过C加减1.96*se得到。并且这种方法也适用于...
cindex.test=1-rcorr.cens(lp_=.test,Surv(noNA$survival,noNA$surv_cens))[[1]] bias=rep(1,bootit) bias[i]=abs(cindex.train-cindex.test) } 以上R代码给的略微简洁,还请见谅! 参考文献: Harrell FE, Califf RM, Pryor DB, Lee KL, and Rosati RA. (1982) Evaluating the yield of medica...
三、R语言代码及参数解读 模拟一组生存数据并设置为数据框结构,age、bp是自变量,os、death为生存结局,把数据框命名为“sample.data”,并展示数据框的前6行: (1)方法1:{survival}包,载入survival包,coxph()函数拟合Cox回归模型,summa...
第一次看到觉得很新鲜,也尝试去搞懂!但并没搞懂,今天冲浪的时候,正好看到有个up主讲的超级好代码+视频,R语言使用BOOT重抽样获取cox回归方程C-index(C指数)可信区间_列线图 c-index计算 置信区间 代码-CSDN博客,我想这个CI-INDEX的靶值可能是采用了BOOT重抽样的方法。于是怎么说,马上立刻copy过来方便自己以后看。
在很多临床文章中经常看见统计方法里面描述模型的区分能力(Discrimination ability)用C-Statistics来度量,下面我们就用R语言为大家演示这个所谓的C-Statistics如何计算?本文先讲解Cox回归中的C-Statistics (一般称为C-index)的计算,Logistic回归C-Statistics计算将在后续文章中介绍。严格说来C-index包括以下几种,我们仅介绍...
我们注意到,在R语言当中,有不同类型的元素放在一起,会返回复杂程度更高的相同类型,比如假设int类型和bool放在一起,那么就会返回两个都是int类型 ## 求元素长度 x1<-c(1:10) #返回数组长度 length(x1) #创建奇数序列 x2<-seq(1,20,2) x2
rcorr.cens的代码及结果，第一个值就是C指数，同时也有Dxy的值 rcorr.cens(sample.data$age, Surv(sample.data$os, sample.data$death))C Index Dxy S.D. n missing 4.528492e-01 -9.430156e-02 5.565299e-02 2.000000e+02 0.000000e+00 uncensored Relevant P...