2. c-di-gmp结构式解释说明: 2.1 c-di-gmp的定义和特点: c-di-gmp(环二磷酸鸟苷)是一种广泛存在于细菌、植物和真核细胞中的小分子信号分子。它由两个鸟苷酸残基通过磷酸二酯键连接形成环状结构。c-di-gmp具有双喜校验模式,可通过两种途径合成和降解,从而实现其浓度的动态平衡。在细菌中,c-di-gmp在调控...
最近的研究表明,BrlR是一种新型3',5'-环状二鸟苷酸(c-di-GMP)受体,可被c-di-GMP激活。为了深入了解BrlR功能,印度加尔各答大学Harikiran等研究人员确定出具有c-di-GMP复合结构的BrlR的结构尺寸为2.5 Å。结构和尺寸排阻色谱(SEC)数据显示BrlR形成四聚体,...
胞内 c-di-GMP 的水平依赖于二鸟苷酸环化酶和磷酸二酯酶的活性,含有 GGDEF 和 EAL/ HD-GYP 结构域的蛋白在 N 端经常会连接信号感应调控结构域,如 PAS 结构域和 REC 结构域。这些调控结构域能够感知胞内外信号,从而调控胞内 c-di-GMP 的水平;此外,c-di-GMP 合成和降解酶之间的蛋白互作及与其他蛋白之间...
高效液相色谱法(HPLC):这种方法是通过测定c-di-GMP的生成量来间接测定其含量。具体的步骤包括设置一个酶活测定反应体系,其中包含DGC酶液、GTP、MgCl2和pH为8.0的Tris-HCl缓冲液。在35℃下反应一段时间后,立即在沸水浴中加热以终止反应。然后将反应液稀释至适合浓度,通过HPLC检测c-di-GMP的生成量。HPLC的具体色谱...
环二GMP(c-di-GMP)又是环二鸟苷-磷酸钠盐、环状双(3'→ 5')二鸟苷酸,英语为Cyclic diguanosine monophosphate,它是一种细胞内的小分子信号分子,广泛存在于细菌和其他微生物中。环二GMP在细菌中起到调控细胞生理过程的重要作用,包括调控生物膜、生物胞外多聚物、生物腈的形成等。通过与特定的蛋白质结合,环二...
环二鸟苷酸(cyclic diguanosine monophosphate, c-di-GMP)作为细菌中广泛存在的第二信使,能够作用于不同的受体调控细菌的多种生理功能,包括生物膜的形成、细菌运动、细菌毒力、细胞周期与分化等。负责合成和降解c-di-GMP 的酶分别为二鸟苷酸环化酶(diguanylate cyclases, DGCs)和磷酸二酯酶(phosphodiesterases, ...
c-di-GMP是一种在细菌中普遍存在的第二信使,在细菌的生物膜形成、分化、运动等多种生物学过程中起着重要的调节作用[31],其调节方式为调控生物膜形成的相关基因,或直接刺激细菌生物膜细胞外基质中胞外多糖的合成和分泌。菌体细胞内c-di-GMP水平由含GGDEF结...
环二鸟苷酸(c-di-GMP)作为细菌中的关键第二信使，广泛参与调控生物膜形成、细菌运动、毒力表达、细胞周期与分化等多种生理功能。其活性依赖于二鸟苷酸环化酶(DGCs)与磷酸二酯酶(PDEs)的动态平衡。DGCs含有GGDEF保守结构域，而PDEs则具EAL或HD-GYP结构域。细胞内c-di-GMP水平由DGCs与PDEs活性决定...
di-GMP(Cyclic diguanosinemonophosp-hate,环二鸟苷单磷酸)是细菌体内普遍存在的一类核苷类第二信使,在细菌的代谢调控中处于中心调节的地位,广泛参与调控细菌的生长和分化,群体感应,生物被膜的形成和分泌,运动性,毒力等生理功能.c-di-GMP也可以作为配体分子识别特定的RNA序列,即c-di-GMP核糖开关.目前己发现c-di...