git clone https://github.com/yezhengSTAT/FreeHiC FreeHi-C installation is finished once you successsfully git clone the repository. The default setting of this FreeHi-C pipeline is a demo run utilizing a real but small Hi-C data:Plasmodium falciparum genome Trophozoite stage. The raw input...
To set up Cpipe, clone this repository and then run the install script: git clone https://github.com/MelbourneGenomics/cpipe.git cd cpipe ./pipeline/scripts/install.sh For further instructions, take a look at theUser Guide.
C Algorithms：一个常用算法和数据结构的集合。官网 CPL：The Common Pipeline Library；一系列详尽，高效...
HI-C数据分析 pipeline(二:数据格式转换) 由于HIC数据目前很难用一个软件就能将全套流程全部分析完,从数据预处理到后续的TAD计算,loop计算等需要用到众多软件,但是在数据格式方面,各大软件又不一致,所以要进行很多的数据格式转换,本文整理一下HicPro数据结果如何对接其他Hi-C后续分析。 一、hicpro得到的数据 用HicP...
Using it as imputer in a scikit-learn pipeline. Using it as a kernel for SVMs. Converting it to TreeLite format for faster predictions. (R examples are available in the internal documentation) Description Isolation Forest is an algorithm originally developed for outlier detection that consists in ...
此仓库是为了提升国内下载速度的镜像仓库,每日同步一次。 原始仓库:https://github.com/explosion/spaCy master cython3 spacy.io fix-windows-crash bugfix/windows-crash bugfix/fix-morph-memory-zone v4 fix-windows-ci v3.8.x fix-serialize v3.7.x ...
【2】创建pipeline任务 (1)新增任务,选择流水线 (2)Pipeline定义有两种方式: 一种是Pipeline Script ,是直接把脚本内容写到脚本对话框中; 另一种是 Pipeline script from SCM (Source Control Management–源代码控制管理,即从gitlab/github/git上获得pipeline脚本–JenkisFile) ...
在一台 macOS 的 anget 中,我们的 pipeline 脚本一直报错:cmake: command not found,但实际系统中已经通过 brew 安装过 cmake。并且在系统中通过使用命令 cmake --version 也能显示正常版本。那是不是 cmake 所在的目录并不在 Jenkins agent 的环境变量中呢?为了验证这个问题我们在 Jenkinsfile 中增加一行打印...
SnapHiC: a computational pipeline to identify chromatin loops from single-cell Hi-C data Article Open access 26 August 2021 Data availability Accession numbers for third-party data used in this study can be found in Supplementary Table 1. The raw data of H9 Hi-C and 4C–seq generated in...
https://github.com/curl/curl 下面我们来从几个方面看看curl的C语言开发规范。 命名 缩进 注释 长行 大括号 'else' 在下一行 括号前不加空格 使用布尔条件 条件中不要赋值 新块在新行上 运算符周围加空格 返回值不加括号 sizeof 参数加括号 列对齐 ...