总结来看,BP、CC、MF分别从功能动态性(过程)、空间定位(结构)和分子机制(活性)三个维度解析基因功能。三者结合可全面揭示基因集在生物学系统中的角色,例如某癌症相关基因集可能在BP上富集“细胞增殖”、CC上定位“细胞膜”、MF上具有“激酶活性”,综合提示其通过膜信号转导...
GO(Gene Ontology)富集分析是一种生物信息学分析方法,用于确定给定基因集中的功能富集或富集的生物学过程。GO富集分析主要涉及三个分支:生物过程(Biological Process,BP)、细胞组分(Cellular Component,CC)和分子功能(Molecular Function,MF)。下面将详细解释这三个分支在GO富集分析中的含义、应用方法,并提供相关的分析步...
基因本体论(Gene Ontology,GO)计划(geneontology.org)为注释基因、基因产物和序列开发了一套结构化的、受控词汇表。它被分成三部分:分子功能(Molecular Function,MF)、生物过程(Biological Process,BP)和细胞组分(Cell Component,CC)。 GO功能富集分析结果,一般都会包含至少4列:GO term,基因数,P值和类别。今天给大家...
基因本体论(Gene Ontology,GO)计划(http://www.geneontology.org)为注释基因、基因产物和序列开发了一套结构化的、受控词汇表。它被分成三部分:分子功能(Molecular Function,MF)、生物过程(Biological Process,BP)和细胞组分(Cell Component,CC)。 GO功能富集分析结果,一般都会包含至少4列:GOterm,基因数,P值和类别。
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5.零代码GO富集分析—柱形图同时展示BP,MF,CC,KEGG 你看下面这篇文章,发表在scientific reports上。虽然被称为四大水刊之一,但是也毫不影响人家的影响因子上4.380。 下面就是这篇文章中的GO和KEGG富集分析图,眼尖的小伙伴应该一眼就能看出是用Excel画出来的。
1.基因富集工具DAVID介绍(一)-基因ID转换 | 2.基因富集工具DAVID介绍(二)-KEGG富集分析 | 3.基因富集工具DAVID介绍(三)-零代码展示KEGG富集结果 | 4.基因富集工具DAVID介绍(四)-GO富集分析及柱形图展示 | 5.GO和KEGG富集分析视频讲解 | 6.KEGG富集分析—柱形图,气
1. BP（Biological Process）代表生物过程，涉及基因或蛋白质参与的生物学活动，例如细胞代谢、信号传导等。2. CC（Cellular Component）指的是细胞组成，描述基因或蛋白质在细胞中的位置和结构，例如核内、线粒体等。3. MF（Molecular Function）指的是分子功能，表示基因或蛋白质所具有的化学活性或能力...
BP（BiologicalProcess）、CC（CellularComponent）和MF（MolecularFunction）是基因功能分类的重要概念。BP指生物过程，描述基因或蛋白质参与的生物学活动，如细胞代谢、信号传导等。CC指细胞组成，用于描述基因或蛋白质所在位置和结构，如核内、线粒体等。MF指分子功能，表示基因或蛋白质具有的化学活性或能力...
GO富集分析是生信文章中常用的一种技术。它可以对基因和基因产物按照其参与的BP(Biological Process,生物过程)、MF(Molecular Function,分子功能)、CC(Cellular Component,细胞组分)三个方面进行分类注释,大致了解某个物种的全部基因产物的功能分类情况,对基因进行注释和分类,将发生差异的基因富...