（1）首先我们设置 BLASTDB 变量，它的值为我们安装 blast 路径下 db 目录所在的路径，如果你的路径不...
【blast教程】DNA(或氨基酸)本地blast数据库建立(用自己的数据建库)发布于 2022-01-26 13:00 · 1352 次播放 赞同添加评论 分享收藏喜欢 举报 数据库测序数据库技术数据库设计DNA 测序Illumina 写下你的评论... 还没有评论,发表第一个评论吧...
你是否会疑问，为什么在建立本地比对库（local blast）时，输入代码后会报错“磁盘空间不足”（如下图），而我的磁盘明明还有几百个G，为什么会这样呢？或许有时候发现在建库时输入makeblastdb -h的建库查看命令后会出现不是内部也不是外部命令的情况。下面我们就来解决一下这些问题。要解决以上问题中的“既不是...
智慧芽生物序列数据库具备一系列特色功能，包括从海量数据中提取的蛋白质和核酸序列数据库，通过人工注释关键生物序列，标注修饰结构，提升序列信息获取效率。数据库还支持公共空间协作，用户可以分享检索结果、生成报告、比较序列比对等。基于深度数据处理技术和独家搜索人工智能算法，智慧芽提供全新的生物序列FTO...
本地blast建库遇到问题请大神帮忙 只看楼主收藏回复 态度决定未来5 秀才 3 各位大神,在本地blast建库时,出现这种情况是什么情况 送TA礼物 来自手机贴吧1楼2018-01-25 18:18回复 trumpsand 白丁 1 楼主解决了吗 来自Android客户端3楼2020-06-09 22:53 回复 ...
接触过生物学的小伙伴对NCBI在线BLAST网页一定不陌生,简单介绍一下这个网页的5种比对工具:blastn、blastp、blastx、tblastn和tblastx,以及如何进行本地建库和blast比对。 blastn 用核苷酸序列检索核苷酸数据库 blastp 用蛋白质序列检索蛋白质数据库 blastx 核苷酸序列通过6种阅读框翻译不同蛋白序列后,检索蛋白数据库 ...
LINUX上安装BLAST+ 先确定操作系统位数，再按步骤安装。# 查看操作系统位数，并选择对应的安装包： get...
1）数据量及数据源 常见的公共免费序列检索数据库，往往存在专利数据收录不全、算法以及保密等问题，不...
1.NCBI下载本地版blast [下载链接]：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST...