-f, --fasta-ref <file>: 指定参考基因组序列的FASTA文件。 -o, --output <file>: 指定输出文件的名称。 -m, --missing <char>: 指定用于表示缺失数据的字符(默认为N)。 -c, --consensus-type <type>: 指定共识序列的类型,可以是most_frequent(默认),majority,all等。
与AC相似,但统计的是小于0.5的等位基因):MAC, alternate等位基因的频率(AF=AC/AN):AF 次等位基因频率(MAF=MAC/AN): MAF 在called genotypes中等位基因的数目: AN 有missing genotype的样本数目:N_MISSING 有missing genotype的样本比例:F_MISSING