AutodockVina是一种常用的分子对接软件,它可以用于计算分子之间的亲和力和结合能。它基于贝叶斯定理和多种搜索算法,能够预测分子之间的相互作用,并确定最佳的结合位点和结合能。Autodock Vina的使用简单直观,准确性得到了广泛的验证和应用。 二、什么是结合能? 结合能是描述分子对接中相互作用的物理量,它用来评估分子之...
Q1: MaXFlow中分子对接采用的是AutoDock Vina,我们都知道AutoDock Vina是开源的,那MaXFlow中的AutoDock Vina与开源中有什么不一样? A: MaXFlow对接所采用的程序就是开源的AutoDock Vina,使用时可以保证与开源程序相同的对接准确度。 MaXFlow将AutoDock Vina程序的参数进行了可视化,在图形界面上即可进行参数设置,用...
具体大家可自行百度检索相关概念。目前分子对接常用软件主要包括AutoDock、AutoDock Vina、LeDock、rDock及UC...
autodock tools 是autodock和vina的前处理图形化界面，主要是为了完成配体，受体和对接区域选择的准备工作...
如果是Autodock First of all you can open ADT Go->analyze->Docking-> open->.dlg file of ...
if hasattr(d.ligMol, 'vina_energy'):AttributeError: Docking instance has no attribute 'ligMol'e...
修改.conf，修改参数num_modes的默认值，一般20，多了也无意义。
请问各位大佬，用vina做的对接，有没有什么免费的软件可以画出相互作用的2D图？window系统，最好有软件...
请教大家，autodock tools和vina, pyrx和raccoon之间有什么区别和联系？如果安装的话，每一组任一个都...