ATAC-seq是一种创新的表观遗传学研究技术,该技术通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割,进而获得在该特定时空下基因组中所有活跃转录的调控序列。 染色体主要由DNA和蛋白质组成,每一条染色单体由单个线性DNA分子组成,细胞核中的DNA是经过高度有序的包装,包装分为多个水平,核小体核心颗粒(nucleosome ...
ATAC技术轻松get!ATAC-Seq完整解决方案 染色质免疫沉淀(ChIP)和RRBS等方法使研究人员更容易在全基因组范围内研究表观遗传修饰。但是,这些方法的潜在局限性之一是您需要对什么表观遗传学机制在其中起作用有初步的想法。 ATAC-Seq向研究人员提供有关整个基因组中可及染色质的信息,而不涉及具体表观遗传学机制。许多研究...
ATAC-seq 是通过使用高通量测序对转座酶可接近性核染色质区域进行分析的一种创新表观遗传学研究技术。该技术通过转座酶对某种特定时空下开放的核染色质区域进行切割,获得在该时空下基因组中所有活跃转录的调控序列,再通过聚类分析,挖掘这些开放位点的潜在结合转录因子,结合基因表达水平数据,发现关键的调控转录因子。 ATAC...
scRNA-seq) 是一种流行且强大的技术， 可一次性解析成千上万个单细胞的基因表达情况，已经广泛应用于...
ATAC-seq只需要很少的细胞就能鉴定基因组中所有活跃的调控序列。背景说明 染色质免疫沉淀（ChIP）等方法使研究人员更容易在全基因组范围内研究表观遗传修饰。但是，这种方法的潜在局限之一是我们需要对某个表观遗传学机制所起的作用有初步的想法。而ATAC-Seq可以向研究人员提供整个基因组中染色质可及性的信息，而不...
2.1 什么是ATAC-seq ATAC-seq (Assay for Transposase-Accessible Chromatin using sequencing) 是分子生物学中用于评估全基因组染色质可及性的技术。 2.2 如何理解ATAC-seq 这里就不得不提及染色质可及性。我们已经知道,染色质是由组蛋白和 DNA 组成。DNA并不是裸露的,而是被包装成核小体形成串珠状结构并进一步被...
ATAC-seq，全名为Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high throughput sequencing，是由美国斯坦福大学的William Greenleaf教授于2013年所研发的全新表观遗传学研究方法。通过利用DNA转座酶结合高通量测序技术，该技术旨在研究染色体的可及性，揭示基因组中所有活跃转录的调控序列。ATAC-seq技术的创新...
ATAC-seq，全称"Assay for Targeting Accessible Chromatin with high-throughput sequencing"，是一种高通量测序技术，用于揭示染色质区域的调控因子结合位点，以及转录因子对核小体位置的影响。其核心原理是利用活性的Tn5转座酶在开放染色质区域（OCR）插入测序接头，然后进行测序，从而推断可接近性区域的特征...
ATAC-Seq是一种高效表观遗传学研究工具，依赖于高活性转座酶Tn5和下一代测序（NGS）技术构建文库。其主要优势在于使用较少细胞（约50,000个）在较短时间内完成实验，且可同时评估开放染色质、核小体定位与转录因子占用。与其他技术相比，它在所需样品数量方面有显著改进，且具备生成高分辨率图谱的能力。...
ATAC-seq的重要性在于揭示DNA的可表达性，即染色质的开放状态，这对于理解为何不同细胞具有特定表型至关重要。基因表达调控的过程涉及多个步骤，包括染色质可及性、DNA修饰和组蛋白修饰。ATAC-seq通过检测这些开放区域，帮助我们识别启动子、增强子和抑制子，从而揭示基因表达的调控机制。不同于其他技术，ATAC...