另一项研究则利用ATAC-seq技术分析肿瘤细胞的开放染色质区域,揭示其在癌症发病机制中的重要性。这些发现为靶向治疗提供了新的理论依据和研究方向。 诺唯赞:助力科研的强大伙伴 诺唯赞不仅提供高性能的实验试剂盒,还通过全面的实验设计、带教及数据分析服务,帮助科研人员提升研究效率和质量。在复杂的实验条件下,诺唯赞...
目前,南京诺唯赞已经全面推出了ATAC测序服务,只需要寄出细胞样品,我们将提供样品处理、建库、测序以及信息分析整套流程,快速、有效的为您解决所有问题。 ATAC测序技术路线 参考文献: [1] Chromatin accessibility: a window into the genome [2] ATAC-seq: A Method for Assaying UNIT Chromatin Accessibility Genome-...
知乎,中文互联网高质量的问答社区和创作者聚集的原创内容平台,于 2011 年 1 月正式上线,以「让人们更好的分享知识、经验和见解,找到自己的解答」为品牌使命。知乎凭借认真、专业、友善的社区氛围、独特的产品机制以及结构化和易获得的优质内容,聚集了中文互联网科技、
4k细胞, 采用诺唯赞TD502建库,去除了500bp以上的片段以及引物二聚体 8k细胞,采用诺唯赞TD502建库,去除引物二聚体 更糟糕了。。 采用的是颉伟老师实验室 miniATAC-seq建库的protocol, 参考文献:Chromatin analysis in human early development reveals epigenetic transition during ZGA 其实步骤挺少的,我在建库的时...
_诺唯赞生物_新浪博客。因为中文的资料太少,我于是到NCBI上碰碰运气,结果还真找到了,今年刚推出的一款分析软件:An Easy-to-use Systematic pipeline for ...名为“esATAC”,意思是方便使用的ATAC-Seq分析系统,Bioconductor上能够找到它的使用介绍http://bioconductor.org/packages/release/bioc/manuals/esATAC/man/...
百迈客携手诺唯赞为您一次讲清 染色质可及性与基因组复制、转录调控密切相关,是表观遗传学的重要研究内容,ATAC-seq因其操作时间短、投入细胞/组织量少、更易获得“开放”染色质信息等特点成为热门技术,可联合转录组进行多组学分析,更深入地了解染色质水平如何调控基因。
而且在图2中泳道1和2都使用的翌圣的kit,不同的是泳道1的接头使用的是翌圣的,泳道2使用的诺唯赞的接头。相比之下,翌圣建库试剂盒+翌圣接头的连接效率更高,文库浓度也更高。 小结📝 总之,ATAC-seq文库构建虽然有点复杂,但只要注意这些小细节,还是能做出高质量的文库的。希望这些小贴士能帮到你们,祝大家实验...
不是,有些不一样,我用的是诺唯赞的Tn5试剂盒,参考的颉伟16年做小鼠胚胎的文章上的protocol 赞 回复 玖肆思思 楼主 2021-04-03 09:21:23 赞 回复 玖肆思思 楼主 2021-04-03 09:40:57 如果你不是做小鼠胚胎,用greenleaf后来那个OMNI- ATAC就好了……先拿Tn5切点genomic DNA确定酶 ... Aliceno1...
bedtools bamtobed -i Aging2.last.bam > /storage2/anlei/MLZ/ATAC-seq/callpeak/Aging2.bed #计算线粒体DNA比例 ps 诺唯赞的技术回的 一般在测序时会注意线粒体DNA的污染率情况。比如少量测序后,线粒体 DNA 的污染率如果没有超过 50%,则不需要进行线粒体 DNA的去除,那么推荐数据量测到 50 M reads...
ATAC-seq 技术作为目前主流的研究染色质可及性技术之一,起始量低、耗时少、重复性高的优势使其得到越来越广泛的应用。诺禾致源致力于 ATAC 的科研服务,拥有丰富的 ATAC-seq 项目经验,涉及多个物种,不仅有标准分析内容,还有ATAC与mRNA关联分析,做您科研道路上可信赖的合作伙伴! 编辑于 2021-12-27 14:38 赞同...