: CpG 是胞嘧啶 “C” 和鸟嘌呤 “G” 的缩写，由磷酸酯 “p” 连接。在哺乳动物中，胞嘧啶甲基化主要发生在 CpG 二核苷酸中。可通过对二核苷酸序列 5'CpG3' 中胞嘧啶碱基的甲基化共价修饰脊椎动物的 DNA。DNA 甲基化分为三个阶段：甲基化的建立 (从头开始 DNA 甲基化)，甲基化的维持和脱甲基。甲基化...
🌟5-甲基胞嘧啶(m5C)是一种在RNA中普遍存在的修饰,对基因表达调控至关重要。然而,由于亚硫酸盐测序(RNA BS-seq)过程中RNA的严重降解和序列复杂性的降低,准确和灵敏地鉴定m5C位点仍然具有挑战性。🌟2024年7月,Molecular Cell(IF 14.5)发表了一项题为“Base-resolution m5C profiling across the mammalian transcr...
5-甲基胞嘧啶(m5C)是哺乳动物mRNA转录后修饰。它由NOP2/Sun结构域(NSUN)RNA甲基转移酶或DNA甲基转移酶2(DNMT2)催化,并可被四甲基胞嘧啶双加氧酶2(TET2)去甲基化。Aly/REF输出因子(ALYREF)识别m5C修饰的mRNA以促进mRNA核输出,而YBX1直接与m5C甲基化的mRNA结合以稳定mRNA。最近研究显示,m5C修饰异常与膀胱癌、胃...
目前还缺乏准确有效的检测m5C的方法。 2024年1月2日,芝加哥大学何川团队在 Nature Biotechnology 期刊发表了题为:Ultrafast bisulfite sequencing detection of 5-methylcytosine in DNA and RNA 的研究论文。 该研究开发出了对微量DNA和RNA上的5-甲基胞嘧啶修饰进行快速,准确检测的测序方法——Ultrafast Bisulfite ...
自从N6-甲基化腺苷在mRNA发现以来,截止目前发现大约有160中修饰核苷(修饰核苷酸),甲基化可发现在不同类型的RNA中,并且具有物种专属性。其中5-甲基胞嘧啶(m5C)已在多种生物的mRNA、rRNA、tRNA中被发现。m5C在RNA具有可逆性,修饰后的RNA对于不同的生物过程影响重大,包括RNA稳定性、蛋白合成、转录调控。
1.RNA m5C在UCB组织中的分布 为了在UCBs中绘制单碱基分辨率下的转录组m5C修饰图,我们对36个UCB和29个邻近正常组织(包括22对癌变和非癌变膀胱组织)进行了改进的RNA亚硫酸氢盐测序(RNA- BisSeq)方法。我们发现,大多数m5C位点(约为90%)存在于mRNA中,并且在在每个样本的2,281-8,957个mRNA中识别出7,204-115,86...
5-甲基胞嘧啶(m5C)转录后修饰影响mRNA分子的成熟、稳定性和翻译。这些修饰在许多生理和病理过程中发挥重要作用,包括应激反应、肿瘤发生、肿瘤细胞迁移、胚胎发生和病毒复制。近年来,随着液相色谱-串联质谱(LC-MS/MS)和RNA-BisSeq等检测技术的快速发展和优化,人们对m5C修饰的生物学意义有了更好的认识。此外,用于识别...
与DNA中的5mC相比,mRNA中m5C的修饰位点以及修饰水平要低得多,因此如何避免常规 BS-seq中所产生的假阳性,降低RNA降解从而精准地检测到m5C位点并定量其修饰比例,一直是 RNA BS-seq 的主要挑战。研究人员进一步优化了UBS-seq 的配方,发现在98度下加热9分钟后,rRNA上所有的C位点的未转化率(背景噪音)仅有1%,而两...
UBS-seq扩展了其功能,即使从低mRNA输入也可以定量绘制RNA 5-甲基胞嘧啶(m5C),从而能够在高度结构化的RNA序列中检测m5C化学计量学。将UBS-seq应用于mRNA显示NSUN2是主要的“写”蛋白,负责HeLa mRNA中约90%的m5C位点沉积。此外,它在哺乳动物mRNA的5 ' -区域突出了丰富的m5C位点,表明在mRNA翻译调节中可能具有功能...
转运RNA(tRNA)修饰5-甲基胞嘧啶(m5C)/3-甲基胞嘧啶(m3C)/7-甲基胞嘧啶(m7C)|简称tRNA-m5C/m3C/m7C 产品名称: tRNA-m5C 转运RNA(tRNA)修饰5-甲基胞嘧啶(m5C) tRNA-m3C tRNA甲基化偶联3-甲基胞嘧啶(m3C) tRNA-m7G 转运RNA(tRNA)甲基化修饰7-甲基胞嘧啶(m7C) 纯度:98% 包装:mg级和g级 地址:西安 服务...