primer 8F and 1492R (name based on location on rRNA sequence) are used to amplify the whole sequence, allowing for the sequencing of several variable regions of the
稀释曲线是利用已测得16S rRNA序列中已知的各种OTU的相对比例,来计算抽取n个(n小于测得reads序列总数)reads时出现OTU数量的期望值,然后根据一组n值(一般为一组小于总序列数的等差数列)与其相对应的OTU数量的期望值(此处采用chao1算法估计),当曲线趋向平坦时,说明测序数据量合理,更多的数据量只会产生少量新的OTU,...
16S rRNA genes. Results:Twelvebacter iawere classif iedto species, .t h eother2bacter iawere classif iedtogenus. Conclusion:16S rRNA gene sequence anaIySis is useful in identify: ing pathogenic bacter ia. KEY W O RDS 16S rRNA;pathogenic bacter ia;analysis ofgene sequence 收稿 日期pat*of...
16S核糖体RNA(16S ribosomal RNA),简称16S rRNA,是原核生物核糖体中30S亚基的组成部分。16S rRNA基因存在于所有细菌的基因组中,长度约为1542bp,包括10个保守区(Conserved region)和9个可变区(Variable region),保守区反映了物种间的亲缘关系,而可变区则反映了物种间的差异 (图1)。 16S rRNA基因,其分子大小适中,...
Keywords:16SrRNA;pathogenicmicroorganism;genesequenceanalysis 病原细菌的鉴定是临床细菌学的一项基本工作。鉴定病原细菌有多种方法,如形态学观 察、血清分型、生化分析、遗传学分析等。遗传学分析法有基因序列分析、分子标记检测、 核酸分子杂交等 [1] 。遗传学分析的候选基因主要有16SrRNA、23SrRNA、16-23SrRNA间 ...
W. Ho, "Sequence analysis of 16S rRNA gene and 16S-23S rRNA gene intergenic spacer region for differentiation of probiotics Lactobacillus strains isolated from the gastrointestinal tract of chicken," Annals of Microbiology, vol. 58, no. 1, pp. 133-140, 2008....
16S rRNA基因测序以细菌16S rRNA基因测序为主,核心是研究样品中的物种分类、物种丰度以及系统进化。 二代高通量测序原理 目前二代测序是一个边合成边测序的过程,使用的是荧光可逆终止子。每个可逆终止子的碱基3’端都有一个阻断基团,而在侧边带有一种荧光。由于有4种不同的碱基(ATCG),因此也会有对应4种不同颜...
nullImpact of 16S rRNA Gene Sequence Analysis for Identification of 热度: 16S rRNA序列分析对痢疾志贺菌分离鉴定 热度: 中南大学学报(医学版) JCentSouthUniv(MedSci) 2013,38(10)http://.csumed;http://xbyx.xysm.net 1035 16SrRNA基因序列分析法鉴定病原细菌 ...
结果表明16S rR NA序列分析获得的鉴定结果与表型分析和气相色谱分析结果较为一致,该方法具有快速、准确和不依赖于细菌生长状态等优点,说明16S rRNA序列分析法可以作为大气微生物分析的一个有效技术。关键词 16S rRNA;序列分析;大气微生物 Application of16S rRNA sequence analysis for the study of atmospheric bacteria...
结果采用 16S rRNA 序列 同源性分析方法与系统发育树构建, 鉴定 201101 菌株、201102 菌株、201103 菌株、201201 菌株和 201202 菌株分别 相应与 唾液乳杆菌、 加氏乳杆菌、 詹氏乳杆菌及卷曲 乳杆菌形成一个分支, 验证可信度均 达到100% ; 201104 菌株 16S rDNA 序列 与鸡乳杆菌的 16S rDNA 序列 同源性达...