主要应用于:(l)检测新的转录本,包括未知转录本和稀有转录本;(2)基因转录水平研究,如基因表达量、不同样本间差异表达;(3)非编码区域功能研究,如microRNA、非编码长RNA (IncRNA)、RNA编辑;(4)转录本结构变异研究,如可变剪接、基因融合;(5)开发SNPs和SSR等。 4、RNA-Seq的基本步骤[11] 提取样本总RNA后,根据...
RNA-seq:RNA-seq是一种第二代测序技术,主要包括Illumina HiSeq和NextSeq等。RNA-seq通过将RNA反转录成cDNA,然后进行扩增和测序,获取RNA的片段序列信息。 2.应用范围: 三代全长转录组测序:由于可以直接测序RNA的全长,三代测序技术在研究转录本的全长变异、剪接异构体和RNA修饰等方面具有优势。它可以提供更全面和准...
转录组技术在医学中的应用 在癌变和其他复杂疾病发生和发展过程中,细胞内的基因表达模式会发生显著改变,RNA-seq可在疾病的预防与治疗有显著的成果。RNA-seq可以通过对照正常样本和疾病样本中表达模式发生显著变化的基因,及其功能分析快速、全面的掌握癌症或者其他疾病发生中基因表达模式的改变,对该疾病的诊断和治疗提供重...
转录组研究能够从整体水平研究基因功能以及基因结构，揭示特定的生物学过程，已广应用于植物候选基因发掘、功能鉴定及遗传改良等领域。随着新一代测序平台的市场化，RNA测序(RNA sequenclng，RNA-Seq)技术已成为了转录组学研究的重要手段之一。该技术利用新一代高通量测序平台对基因组cDNA测序，通过统计相关Reads（用于...
荧光原位杂交 (FISH) 和实时定量聚合酶链反应 (RT-PCR) 尽管敏感度较高,但是只能检测单个融合基因。此外这些方法不能够识别新的融合基因伴侣或者解析复杂的结构重组。靶向RNA测序 (RNA-seq) 能够克服这些限制,敏感地检测到罕见或者较低表达的转录本。 FISH 及RT-PCR是诊断基因融合的常规方法,而靶向RNAseq使用生物...
1349 -- 15:55 App 转录组测序(RNA-seq)数据的比对及质控 364 -- 24:33 App Rna-Seq Experimental Design RNA测序 3284 -- 11:23 App RNA-seq数据分析 304 -- 30:12 App 差异基因的注释及转录组测序的应用 562 -- 25:21 App RNA-seq 定量分析 356 -- 36:28 App 如何在R中分析单细胞...
空间转录组是一种用于从空间层面上解析RNA-seq数据的技术，从而解析单个组织切片中的所有mRNA。空间条形码逆转录oligo(dT)引物在显微镜载玻片表面的有序附着，使得在mRNA样品处理和后续测序过程中位置信息的编码和获取成为可能。单细胞RNA测序或组织样本RNA测序，均无法为研究人员提供精确的空间信息。通过空间转录组技术可...
RNA测序(RNA- seq)是目前分析基因表达和发现新RNA物种的常用方法。可以用专门的方法来研究cDNA文库的制备解释RNA生物发生和代谢方面的问题。在本研究中,我们综述了目前用于基因表达一般分析的RNA-Seq方法和几个特定的应用,包括亚型和基因融合检测、数字基因表达谱、靶向测序和单细胞分析。此外,我们还讨论了在细胞中检测...
转录组是指一个细胞、组织或生物体在特定条件或状态下转录的所有RNA集合。RNA-Seq利用新一代测序技术，通过测序细胞或组织中的所有RNA，分析其种类和丰度，从而获得基因表达的全景图。转录组测序的主要步骤包括：RNA提取、构建文库、测序和数据分析。二、转录组测序的主要步骤 RNA提取：从样本（如细胞、组织、血液等）...