据估计,人类基因组中有20%的基因编码细胞表面蛋白,10%的基因编码分泌蛋白,这充分说明了细胞表面PPI所发挥的重要作用【2】。目前为止,还没有一个全面的人类细胞表面相互作用图谱被绘制出来,其主要难点在于PPI的亲和纯化和质谱的数据集不够充分,且通常具有广泛亲和力范围(几nM到几百nM)的快速结合动力学反应。导致其...
要理解这一套方法,我们首先要明白蛋白质基序的定义:如下图所示,在蛋白质-蛋白质相互作用的界面上,存在两种局部片段介导的相互作用,其中一种既有高度的结构保守性,也有高度的序列保守性,我们称之为序列PPI基序;而另外一种,虽然有着高度的结构保守性,但是其序列上几乎没有任何保守性,这就使得传统的基于序列比对的方...
随着我们对蛋白-蛋白间相互作用(PPI)的理解的增强,蛋白质结构数据可用性的增加,以及机器学习的进步,为改进设计蛋白-蛋白间相互作用(PPI)的方法奠定了基础。 近日,洛桑理工学院、牛津大学、中国科学院微生物研究所的研究人员合作,在Nature期刊发表了题为:De novo design of protein interactions with learned surface fi...
另一方面,与疾病密切相关的蛋白-蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)的界面区域缺乏明确的配体结合口袋(ligand-binding pocket),并且不存在酶催化活性位点(active site)中常见的高度活化氨基酸残基,因此,开发以PPI为靶点的共价抑制剂...
蛋白-蛋白间相互作用(protein-protein interactions,PPI)在几乎所有的生物学过程中都发挥着重要作用,包括信号转导、细胞生长和免疫防御等,其介导对细胞生理学重要的生物学功能。相互作用的蛋白质通过对突变的采样(主要是在蛋白-蛋白界面)共同进化了数千年,以实现所需功能的“最佳匹配”,这一过程很难在实验室中重现。
蛋白-蛋白间相互作用(Protein–protein interactions,PPI)在几乎所有的生物学过程中都发挥着重要作用,包括信号转导、细胞生长和免疫防御等。鉴于这些相互作用在内稳态和疾病反应中的关键作用,与体内蛋白质相互作用的合成蛋白质(例如工程化抗体)代表了现代医学中最具变革性的治疗方式之一。
蛋白-蛋白间相互作用(Protein–protein interactions,PPI) 在几乎所有的生物学过程中都发挥着重要作用,包括信号转导、细胞生长和免疫防御等。鉴于这些相互作用在内稳态和疾病反应中的关键作用,与体内蛋白质相互作用的合成蛋白质(例如工程化抗体)代表了现代医学中最具变革性的治疗方式之一。 而目前大多数合成蛋白质都是在...
细胞功能受蛋白质,核酸及其相互作用(包括蛋白质与蛋白质的相互作用(PPI),蛋白质与RNA的相互作用以及蛋白质与DNA的相互作用)严格调节。 这种分子相互作用网络是大多数生物过程的核心,而其失调与多种人类疾病有关,包括癌症,免疫疾病和神经退行性疾病。 ...
蛋白质相互作用(PPI) 可以说是人体最重要的分子事件之一,事关人体的生长发育、新陈代谢,是疾病治疗干预的重要来源,PPI 的失调会导致癌症等疾病的发生,因而该领域也是医药领域关注的研究热点。 为了更好地预测和解读 PPI,并深入挖掘相关分子的信息,2023 年 3 月,腾讯 AI Lab 联合香港科技大学、中国科学院大学相关团...
蛋白质相互作用(PPI) 可以说是人体最重要的分子事件之一,事关人体的生长发育、新陈代谢,是疾病治疗干预的重要来源,PPI 的失调会导致癌症等疾病的发生,因而该领域也是医药领域关注的研究热点。 为了更好地预测和解读 PPI,并深入挖掘相关分子的信息,2023 年 3 月,腾讯 AI Lab 联合香港科技大学、中国科学院大学相关团...