图1研究蛋白质“液-液相分离”的计算方法: 从左至右分别是解析模型、粗粒化模型(包括多个残基单个粒子、单个残基单个粒子、单个残基多个粒子的模型)和全原子模型, 分辨率的提升对计算资源的耗费程度急剧增高, 而模型假设数的减少会减弱研究涌现行为的能力[35] ...
主要研究内容如下:(1)针对自发生液-液相分离现象的蛋白质,本文根据LLPSDB数据库中液-液相分离蛋白的浓度是否小于100μM的实验条件,将发生液-液相分离现象的蛋白分为强液-液相分离和弱液-液相分离两类数据.然后将七种序列特征,四种进化信息特征和三种嵌入特征分别与五种传统机器学习方法构建模型,将四种进化信息特征与...
蛋白质液-液相分离(LLPS)是细胞内多种功能的基础,对于分析细胞功能、治疗疾病和设计新型生物材料具有重要意义。研究者们已经识别出多个推动蛋白质LLPS的序列特征,并将其概括为LLPS的“分子语法”。本文进一步探…
液液相分离的条件与液液相平衡曲线也有关系。液液相平衡曲线是指在两个相容的液体中,它们的理论组成比为不同的时候,两个相之间的平衡关系。通常情况下,液液相平衡曲线呈现出一个S形状的曲线,曲线上半段表示半成分的蛋白质分布在水相中,而曲线下半段则表示半成分的蛋白质分布在有机相中。 蛋白质液液相分离可以通...
在过去的研究中,大隅博士也发现,处于饥饿状态的酵母在形成自噬体前,Atg蛋白会聚集到一处,虽然功能未知,但大隅博士将其命名为 “前自噬体结构(PAS)”。由于 “液-液相分离” 形成的液滴与PAS相似,因此野田决定通过 “液-液相分离”...
可以通过蛋白质中的低复杂度(lc)结构域促进的液-液相分离(llps)与医学意义在生理学上高度相关;例如,影响蛋白质的llps能力的突变可以驱动神经退行性疾病如肌萎缩性侧索硬化症(als)和泛素阳性额颞叶变性(ftld-u)的发病机制。我们的研究小组探索被像贻贝、藤壶和沙堡蠕虫那样的海洋生物使用的锚定斑块启发的生物启发的...
奕拓医药突破不可成药的方式是液-液相分离技术。因为他们发现,很多不可成药的靶点蛋白会通过液-液相分离行使功能,典型为转录因子和磷酸酶。奕拓在AACR展示的核心产品,均以转录因子为靶点。 奕拓将在2024年DJS创新合作峰会参与路演环节。 撰文| 殷丹妮 刚结束的AACR会议,奕拓医药展示了管线中三款核心产品的壁报。产...
利用核磁共振波谱学分析，表明EB1蛋白的各个区域间均存在弱相互作用力，提示EB1蛋白分子间各区域的多价弱作用驱动其发生液液相分离，因此EB1蛋白完整性对于其蛋白相分离性质至关重要。图1 超高分辨率细胞成像表明EB1蛋白具有潜在的蛋白相分离能力。A. COS-7细胞中转染EB1-GFP和mCherry-tubulin质粒，并进行GI-SIM超高...
然而, 无膜细胞器的 形成机制和功能仍有待进一步解析.研究表明, 液-液相分离(LLPS)可以使细胞内的特定分子聚集形成凝聚体, 进而发挥重要 作用.随着植物中LLPS研究的不断深入, 相分离形成的凝聚体在植物生长发育和胁迫应答过程中的作用备受关注.该文对 蛋白液-液相分离调节植物生长发育以及胁迫应答的研究进展进行...
蛋白质液-液相分离(Liquid-liquidphase separation,LLPS),是细胞内众多无膜细胞器(membraneless organelles)和生物分子凝聚体(biomolecular condensates)动态组装的主要驱动力。鉴定相分离蛋白需要多种实验,其中,体外重构相分离实验通过严格控制各种条件,可以更方便地研究相分离现象;而细胞内,尤其是生理条件下相分离现象的鉴...