答案:脱靶效应在英语中通常被称为"off-target effect"。 分析:在生物学、医学和药物研究中,这个词经常被用来描述一个药物或治疗方法不仅作用于其预期的目标,还可能影响其他非预期的生物分子或途径,从而产生不希望的副作用。 然而,这个词也可以在其他上下文中使用,比如描述一个策略、计划或行动没有达到预期的目标,而...
但CRISPR技术存在的脱靶效应(Off-target effect)依旧是影响CRISPR技术能否广泛应用的主要限制因素,如何正确评估、检测脱靶效应,并提出相应的策略降低脱靶效应是当前基因编辑研究领域的重要研究方向。人们正在努力通过生成各种具有高保真度和准确性的CRISPR / Cas系统,来减少CRISPR / Cas9的脱靶效应。 2020年2月6日,国际知名...
这就是让人无语的siRNA 脱靶效应,脱靶可能导致无法正确解释基因功能。 siRNA 作用过程中存在非特异性,有时候会与非靶基因之外的其它基因作用而非特异地阻断基因表达,产生意料之外的效用称为 siRNA 脱靶效应(off-target effects,OTEs)。目前已知...
该方法以大规模化合物-靶点活性数据为基础,重点收集与心脏、中枢神经系统、胃肠道、免疫系统的毒性密切相关的药物靶点及其活性化合物数据,包括GPCR、离子通道、酶(激酶)、单胺转运体和核受体;进而,利用多任务图神经网络精确预测化合物的脱靶谱(Off-target profile)。由于化合物的靶标杂泛性是其安全性的关键决定因素,...
RNAi实验中脱靶效应(Off-Target Effect)要想了解脱靶效应的由来以及如何有效的避免脱靶效应，我们首先需要了解RNAi的机理。在早期的研究中，人们对于RNAi的机理了解如下图示：dsRNA被Dicer剪切加工成为siRNA，siRNA的双链中的反义链参与RISC的结合进而沉默靶基因的表达(狭义的基因沉默理论)。目前更为广义的RNAi机理应当包括...
siRNA 作用过程中存在非特异性,有时候会与非靶基因之外的其它基因作用而非特异地阻断基因表达,产生意料之外的效用称为 siRNA 脱靶效应(off-target effects,OTEs)。目前已知脱靶效应在 mRNA 水平和蛋白质表达水平上都能够检测出来。 脱靶可能与模体匹配、结构和长 CSRNA 等有关。
一直以来我们都知道CRISPR-Cas9的最大的隐患是脱靶效应(off-target effect)。近几年来有研究表明CRISPR-Cas9还有其他的隐患,每次这些相关性文章一发表,CRISPR相关公司的股票都会出现大跌。今天我们先就脱靶效应来聊一聊,并且提出检测方法。 2. HDR还是NHEJ
off-target effects; OTEs 所属学科 生物学美国学者A.杰克逊[注]于2003年首次提出脱靶效应。当细胞转染某个特定靶基因的siRNA后,检测结果显示,除靶基因外还有大量其他基因同时被非特异性调控。基于狭义的RNAi原理,双链RNA(dsRNA)被Dicer酶剪切加工成为siRNA,siRNA双链中的反义链参与RNA诱导沉默复合物(RISC)的结合,...
近日,中国农业科学院深圳农业基因组研究所左二伟团队在Cell Research期刊发表了题为:Reducing off-target effects of DdCBEs by reversing amino acid charge near DNA interaction sites 的论文。 该研究利用DddAtoxin晶体结构数据以及AlphaFold2蛋白质三维结构预测技术,预测了脱靶效应产生相关的重要氨基酸位点,利用蛋白工程...
本文将解读发表在Nature protocols的综述“Tools for experimental and computational analyses of off-target editing by programmable nucleases” 来探究CRIPSR脱靶效应。研究人员概述并分析了鉴定CRISPR-Cas9系统中脱靶位点的常用方法,评估了它们的优缺点,并提出了准确鉴定脱靶位点和量化脱靶效应目前所面临的挑战。 背景 CR...