1,调整FeaturePlot颜色,大小 (1)Seurat 修改 有以下几种方式,可以使用FeaturePlot 内置的cols参数进行修改(p2 , p3),也可以使用ggplot2的方式 添加scale 进行修改(p4) 代码语言:javascript 代码运行次数:0 运行 AI代码解释 p1<-FeaturePlot(object=sce2,features="CD3D")
方法1:使用 viridis 科学配色 FeaturePlot(pbmc, features = "CD3D", cols = viridis(10)) # 10级颜色梯度 方法2:手动定义双色渐变(低表达→高表达) FeaturePlot(pbmc, features = "CD3D", cols = c("lightgrey", "#E64B35FF")) # 灰色到深红 2.2 调整点参数 目标:缓解点重叠,突出表达信号 FeaturePl...
本文首发于 生信补给站 : scRNA分析 | 定制 美化FeaturePlot 图,你需要的都在这 单细胞常见的可视化方式有DimPlot,FeaturePlot ,DotPlot,VlnPlot 和DoHeatmap几种,Seurat中均可以很简单的实现,但是文献中的图大多会精美很多。 之前跟SCI学umap图| ggplot2 绘制umap图,坐标位置 ,颜色 ,大小还不是你说了算 介绍过...
FeaturePlot(object= sce2, features ="CD3D",pt.size =1,order = T) +scale_colour_gradientn(colours = rev(brewer.pal(n =10, name ="RdBu"))) +DarkTheme() +theme(text=element_text(size=14))+theme(text=element_text(face ="bold"))+theme(legend.text=element_text(size=8)) 此处简单的...
本文介绍FeaturePlot的美化方式,包含以下几个方面 : (1)调整点的颜色 ,大小 (2)展示基因共表达情况(点图,密度图) (3)优化Seurat分组展示 (4)ggplot2修改theme ,lengend等 (5)批量绘制 一载入R包,数据 仍然使用之前注释过的sce.anno.RData数据 ,后台回复anno即可获取 ...
本文介绍FeaturePlot的美化方式,包含以下几个方面 : (1)调整点的颜色 ,大小 (2)展示基因共表达情况(点图,密度图) (3)优化Seurat分组展示 (4)ggplot2修改theme ,lengend等 (5)批量绘制 一载入R包,数据 仍然使用之前注释过的sce.anno.RData数据 ,后台回复anno即可获取 ...