这种方法是先对细胞进行聚类,然后再根据细胞群的平均值的中心点去构建轨迹。同时计算其他细胞到假定轨迹的距离,并将这些细胞分配到在假定轨迹上距离最近的细胞群。同时在这个环节,我们也需要根据先验知识去适当的调整起点位置。 4、单细胞拟时序/轨迹分析把细胞群之间的差异进一步细化到单个细胞的水平并进行展示出来。 分...
这种方法是先对细胞进行聚类,然后再根据细胞群的平均值的中心点去构建轨迹。同时计算其他细胞到假定轨迹的距离,并将这些细胞分配到在假定轨迹上距离最近的细胞群。同时在这个环节,我们也需要根据先验知识去适当的调整起点位置。 4、单细胞拟时序/轨迹分析把细胞群之间的差异进一步细化到单个细胞的水平并进行展示出来。 分...
label_groups_by_cluster=F, 之后不会把细胞类型映射到聚类分群之后的细胞上 label_groups_by_cluster=T, 之后会把细胞类型映射到聚类分群之后的细胞上 这个分析在细胞数量和种类多的时候就会有很大的视觉效果。 7.找出每个簇表达的标记基因 代码语言:javascript 复制 marker_test_res<-top_markers(cds,group_cells...