Uniprot数据库 •Uniprot(Universal protein resource)是蛋白 质序列的联合数据库。 SIB: Swiss Institute of Bioinformatics EBI: European Bioinformatics Institute PIR: Protein Information Resource 2002年三家联合形成了Uniprot Swiss‐Prot •1986年建立
除存储数据外,还包含文献和生物学注释信息...成员 UniProt Archive是一个稳定的、非冗余的、有多种来源的蛋白质序列数据库生物信息学领域核心数据库:NCBI和EBINCBI重要资源PubMed 提供2400万条引用以及许多 NCBI-SRA数据下载 SRA数据库, 为SequenceRead Archive的缩写。主要存储高通量测序的原始数据,来自四个测序平台...
通用蛋白质资源(UniProt)包含Swiss-Prot(手动注释和审阅)和TrEMBL(自动注释且未审阅)数据库,以获取蛋白质序列信息。 6 数据集成和当前方法 已经开发了几种数据集成方法来集成某些类型的组学数据。 另外,已经创建了大数据存储库来存储来自各种疾病的测序实验的数据。 这些资源提供了有价值的构建基块和大量生物样本,可...
4.利用高级检索功能,从UniProt数据库中检索你课题相关或最感兴趣的蛋白质,阅读其注释信息和相关文献,并通过数据库交叉链接,总结该蛋白质的研究进展。 5.序列条目注释信息 1)以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目的注释信息包括哪几个主要类别。 2)以人血红蛋白alpha亚基为例,说明该序列条目中和序列及序列上不...
研究人员基于质谱等技术,量化了水稻主要组织中超过15000个基因的蛋白质水平,鉴定了8964个UniProt数据库中已记录的蛋白质,并为另外7077个蛋白编码基因提供了蛋白质水平证据,从而绘制出水稻全景定量蛋白质组图谱。通过对水稻各组织中的特异性蛋白和富集蛋白进行分析,揭示了与组织功能相关的关键生物学过程和途径。研究人员还...
该模块的主要函数是 Bio.SeqIO.parse() ,它用于读取序列文件生成 SeqRecord 对象,包含两个参数:第一个参数是一个文件名或者一个句柄( handle)。句柄可以是打开的文件,命令行程序的输出,或者来自下载的数据(请见第 5.3 节)。更多关于句柄的信息请见第 22.1 节。 第二个参数是一个小写字母字符串,用于指定序列...
查询UniProt数据库中登录号Q60751信息,下列描述正确的是()。A.第33和52位氨基酸可能形成二硫键B.第102位氨基酸可能以N-连接形式与糖分子结合C.第31
以下哪个数据库是生殖特有的数据库 A. Genecard B. HPA C. Uniprot D. OKDB E. MGI 查看完整题目与答案 高参数、大容量机组通常采用N2H4保护,直流炉和汽包炉均适用。() A. 正确 B. 错误 查看完整题目与答案 父母( )对孩子习得良好的社会性行为有很大作用。 A. 树立良好的榜样 B. ...
基于同源序列的蛋白质功能预测基于同源序列的蛋白质功能预测预测的基本步骤预测的基本步骤p将未知功能的蛋白质序列作为查询序列利用序列比对算法,例如BLAST、PSI-BLAST、 PHI-BLAST 、FASTA等,搜索已注释的蛋白质序列数据库(如UniProt/SwissProt等),找出与查询序列相似的序列,进而从相似序列的功能特性分析外推查询序列 22...
20、基于对tmbase的统计分析, tmbase是一个自然发生的跨膜蛋白数据库。作出的预测是通过几个权重计分矩阵的结合得到的。 序列gi|4506183|ref|np_002779.1| proteasome alpha 3 subunit isoform 1 homo sapiensmssigtgydlsastfspdgrvfqveyamkavensstaigirckdgvvfgveklvlsklyeegsnkrlfnvdrhvgmavaglladarsladiareeasnfrs...