空间蛋白质组学可以在组织切片上解析蛋白质原位分布差异,帮助识别肿瘤微环境中的不同细胞群体蛋白特征和其相互作用。2024 年 8 月 13 日,东方肝胆外科医院联合中国科学院计算生物学重点实验室在Genome Medicine(IF=10.4)上发表论文(DOI: 10.1186/s13073-024-01367-8),对6 名患者的24个通过LCM获取的
本着探索和绘制生物复杂性的精神,我们选择了空间蛋白质组学作为我们的年度技术,因为它在揭示复杂组织的组织中发挥了关键作用。空间蛋白质组学是一个总称,涵盖了广泛的基于免疫组织化学的方法,包括但不限于循环免疫荧光(cycIF)、索引共同检测(CODEX)、迭代褪色...
现有空间蛋白质组方法主要依赖抗体染色或质谱技术，前者因靶标数量有限，仅能检测几十至几百种蛋白分子；而后者尽管检测种类丰富，但逐点取样的方式极大增加了实验成本和规模。例如，对1平方厘米的组织切片进行100微米分辨率的网格分析，需要检测上万个LC-MS/MS样本，远超出现有质谱检测通量的能力。研究创新与优势 1基...
自2021年6月首次推出空间蛋白质组以来，景杰生物不断对技术与体系进行全面优化，一次次刷新着空间蛋白质组学的研究边界。如今，景杰生物再次重磅推出“全息空间蛋白质组学”，为空间蛋白质组学研究提供了更为强大的工具。全息空间蛋白质组学依托于景杰生物创新的10X Proteomics平台，该技术能够支持组织微环境的全覆盖...
已经被大家所熟知的空间转录组基于转录组信息推测细胞功能和细胞之间的互作仍存在一定局限性,虽然mRNA及其同源蛋白之间有一定的相关性,但从mRNA到蛋白质的翻译过程是高度调控和非线性的。 空间蛋白质组是一种直接进行无偏差的大规模蛋白质的定位、定性、定量分析的前沿性技术。该技术...
01兼容不同样本需求景杰生物空间蛋白质组学技术兼容各类包埋组织(FFPE、OCT)或切片,兼顾多种染色方法 (HE/IHC/IF),并支持激光捕获显微切割及显微辅助切割,为空间组学研究提供无限可能。 图2 空间蛋白组送样指南 02高性能质谱仪集群助力作为蛋白质组学与修饰组学分析行业领跑者,景杰生物拥有业内最高格、全面类型的...
现有质谱空间蛋白质组学技术主要包括基于MALDI的质谱成像、激光显微切割和膨胀水凝胶放大后切割等。其中，质谱成像可检测蛋白种类有限，后两种方法的成本和质谱检测通量要求高，使得其在研究中的广泛应用受限。#蛋白质组学# 2025年2月，中国科学院动物研究所赵方庆团队联合国家蛋白质科学中心（北京）王贵宾在Cell杂志上...
空间蛋白质组学研究可以识别细胞亚群，并保留其空间位置信息，从而揭示详细表征患者血管细胞组成变化和相互作用。材料方法 研究队列包含了19名SSc患者和14名对照者，提取皮肤活检样本后开展空间蛋白质组学研究。蛋白抗体的选择包含了用于识别血管内皮细胞（VECs）、淋巴管内皮细胞（LECs）和免疫细胞亚群（如CD3、CD20、CD68...
空间蛋白质组学(Spatial Proteomics)是一种研究蛋白质在细胞和组织中的空间分布和定位的技术,它通过高分辨率成像技术与质谱分析,可精准定位和定量蛋白质在生物体内的具体位置。空间蛋白质组学在传统蛋白质组学主要关注蛋白质整体表达水平的研究范畴上加入了蛋白质的定位信息,这一技术不仅可揭示蛋白质在细胞内不同区域(...
空间蛋白质组学用于研究蛋白质空间表达谱变化，因此组学开展前需通过染色识别目标组织区域或细胞类型并进行精准切割。景杰生物在原有HE染色的基础上，技术升级到IHC/IF染色技术，同步支持更多的样本类型和研究方案。实验结果表明，染色对检测深度的影响小于5%。通过对石蜡切片以及冰冻切片进行特异性IHC/IF染色确定切割区域...