该研究利用nanopore和illumina技术对番茄品种microtom进行了基因组测序,组装成仅有60个contig,大小为799m的高质量基因组,其中两条contig达到了无缺口的染色体水平.该研究同时整合了来自番茄不同组织器官,多个发育阶段和不同处理方式的3组全长...
此前已公布的Micro-Tom和M82基因组在染色体水平gap较多、连续性差,极大影响了后续基因功能研究。因此,测序并组装更高质量的Micro-Tom和M82基因组对于提高番茄育种效率和品质改良具有重要意义。 2024年6月17日,Journal of Genetics and Genomics在线发表华东师范大学生命科学学院姜伊娜教授团队题为“Near-completede novoge...
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Micro-Tom番茄矮化微型机制及其在植物功能基因组学研究中的应用
micro-tom 番茄全基因组测序.pdf,Aoki et al. BMC Genomics 2010, 11:210 /1471-2164/11/210 RESEARCH ARTICLE Open Access Large-scale analysis of full-length cDNAs from the tomato (Solanum lycopersicum) cultivar Micro-Tom, a reference system for the Solanaceae
图3. MicroTom番茄生长周期中代谢物和基因表达的动态。K-均值的聚类分析将番茄代谢组(红色)和转录组(蓝色)的表达谱分为10个簇。x轴描述了来自3个关键发育阶段的20个样品,y轴描述了每种代谢物(红色)和基因(蓝色)的标准化Z-值。每个小图中显示的数字(如簇I中的67个代谢物和4,543个基因)是基于每个簇内所有...
Micro-Tom番茄植株矮小,生长密度高,生命周期短,容易被高效转化,成为功能基因组 学研究的新型模式植物.文章对Micro-Tom的由来和生物学特征作了概述,重点阐述了Micro-Tom矮化微型的遗传机制以及该番茄在功能基因组学 研究中的应用和遗传转化体系研究的进展.关键...
Micro。Tom番茄在功能基因组学研究申的应用 3.1适于瑭缝基毽组学研究的特征 与普通番茄相魄,应用Micro.Tom番茄开展基因组学研究可大大节省时阎和空阚,且 出予对光照要求较低薅使植物培育从温室转入檀物实验室成为可能,这使得转基霞檀檬管 具有以下侥予普通番茄昀适于功能基因纽学研究的特征:④植株矮小,种植密度...
Micro-Tom番茄离体再生条件的选择
番茄转基因植株再生体系的优化 番茄(Solanum lycopersicum)作为重要的模式植物,其基因组大小为 950 Mbp, 共编码 35 000 个基因,遗传学背景较为清楚.Micro-Tom 是一种番茄突变体,具 有生命周期短、株型矮小,比普通番茄更适合用于遗传转化的特点[1-2].但与其 他植物一样,Micro-Tom 在遗传转化后往往出现愈伤组织...