势能面扫描可用于研究一个区域内的势能面,通常是在不同结构上执行一系列的单点能计算,得到能量或其他性质随几何结构变化的情况。势能面扫描分以下两种类型: 刚性扫描 (rigid scan) 只改变被扫描的变量,而分子内其他变量固定不变,对分子进行一系列的单点能计算。 柔性...
柔性扫描不像刚性扫描一样在文件末尾以两列的形式给出扫描变量和能量,若要取出能量,可以借助GaussView,在上述图势能曲线处右击,选择Save Data,即可将扫描变量与能量写入txt文件中。 柔性扫描势能曲线与刚性扫描得到的势能曲线形状相同,但是由于进行过限制性优化总体能量更低,而且几个势能面上的极大值相对能量也有差别。
在Gaussian里做刚性扫描很简单,关键词里写上scan,然后对要扫的变量进行定义即可。键长、键角、二面角都可以扫描,被扫描的几何坐标必须以变量形式表达。比如某个键长变量原本定义是B1= 1.3,那么把这个变量设置改为B1= 1.3 10 0.1,就代表以1.3埃为初始值扫描10步,每步增加0.1埃,最终扫到1.3+10*0.1=2.3埃。由于...
势能面扫描可以用来研究势能随少数几个坐标变化的情况,分为刚性扫描和柔性扫描两种。刚性扫描是指被扫描的坐标变化后,不改变未被扫描的坐标,相当于做一系列单点能计算。对于刚性扫描,本公众号之前已经有过介绍,见《用高斯做势能面扫描(一):刚性扫描》。柔性扫描是指...