对于5G测序量的理解:5G指有5×10*9个碱基,假如测序为单端100nt或双端50nt,则可以得到的reads数为50M(Million) 二、测序深度 概念:测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值,可以理解为基因组中每个被测到的碱基重复被测序的的平均次数(以碱基数量为单位) 测序深度计算= reads长度 × 比对的reads数目 / 参考...
reads数计算 测序深度或者覆盖度（coverage or depth）是指参考序列⼀个碱基上⽐对的reads的数⽬。计算公式为：测序深度 = reads长度 × ⽐对的reads数⽬ / 参考序列长度 miRNA测序 miRNA测序只需要10M read（现在测序成本低，可以测到100M也没问题），每条read长50bp，单端测序。⽽ChIP-seq，需要20M ...
ATAC测序数据需要多少reads? 覆盖率和读取深度是衡量文库测序情况的指标。从视觉上看,覆盖率是从水平方向来说的,而读取深度是从垂直方向来说的。覆盖率或覆盖宽度回答了“测序覆盖了多少样本?”。它可以表示为测序读数覆盖的碱基百分比,例如95%的覆盖率表明样本中95%的碱基已经测序。 读取深度或测序深度表示检测到...