# 首先使用 mutate 函数添加一个名为 'id' 的列,值为 'pkhl' # 然后通过 filter 函数筛选出参考细胞类型为 'Podoplanin' 和相邻细胞类型为 'CD4 Memory T cells' 的数据 # lines = TRUE 表示在可视化中绘制线条,withPerms = TRUE 表示包含重排信息,zSigThresh = zsig 表示使用前面计算的显著性阈值 dat ...
常规矩阵柱状图绘制 有如下4个基因在5组样品中的表达值 data_ori <- "Grp_1;Grp_2;Grp_3;Grp_4...
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接下来,加号后面的geom_bar参数,是我们绘制多序列柱状图所需要设定的,其中position参数设置为"dodge"就...
ggplot(data=testData, aes(x=x, y=y, fill="#FFCC00")) + geom_bar(stat="identity") Run Code Online (Sandbox Code Playgroud) 如果要绘制未在第一个ggplot()行中调用的数据帧中的数据,则只需将数据参数添加到使用该不同数据帧的"层",如下所示: ggplot(data=testData,aes(x=x,y=y)) + ge...
# 下调基因富集,使用enricher函数做功能富集分析,TERM2GENE参数制定通路与基因关系 kk.down <- enricher(gene = gene_down,pvalueCutoff = 0.9, qvalueCutoff =0.9, TERM2GENE=kegg_term) head(kk.down)[,1:6] dotplot(kk.down) barplot(kk.down) ...
p<-p+geom_bar(stat="identity") 1. 最后,我们可以使用print函数或者直接执行图形对象来显示柱状图。 print(p) 1. 解决柱状图列没有名字的问题 如果在创建柱状图时,你发现柱子对应的列没有名字,可以通过修改x轴标签来解决这个问题。在ggplot2中,可以使用labs函数来修改标签。
您可以使用geom_bar(stat = ...)在条形图中聚合数据。geom_col()只是geom_bar(stat = "identity")的便利函数。设置stat = "summary"和fun = sum将对每个组的数据求和,从而避免划分。 library(ggplot2)app_usa <- read.csv(choose.files(), header = TRUE)ggplot(data = app_usa, aes(x = year, y...
在R语言编程中,我们时常会遇到一些常见的错误,其中之一就是“没有subest函数”的提示。这通常意味着我们试图调用一个名称错误的函数。实际情况是,R语言中并没有subest这样一个函数,正确的函数名称是subset。本文将通过示例阐明这一点,并展示如何在R中有效使用subset函数,以及如何可视化数据。
geom_bar(stat = "identity", show.legend = FALSE)+ scale_fill_manual(values = character_palette)+ scale_y_continuous(name ="Log Odds of Word", breaks = c(0,1,2)) + theme(text = element_text(family = "Franklin"), # axis.title.x = element_text(size = rel(1.5)), ...