由于日本晴和93-11中有大量的同源序列,作者开发了BASCGF(BioNano Assisted Sequence Correction an d Gap Filling)软件,利用组装较完善的日本晴基因组来完善93-11 基因组。3419个差异性区域中,873个得到了修正。最终,93-11的基因组包含372.48Mb,共修正了12.93Mb序列,完全填充了5703个gaps,部分填充了455个gaps。这...
《水稻93-11和“日本晴”剑叶衰老的蛋白组学研究》是卢庆陶为项目负责人，中国科学院植物研究所为依托单位的青年科学基金项目。科研成果 项目摘要 以完成基因组测序的籼稻93-11和粳稻日本晴这两种水稻作为研究对象，对水稻剑叶成熟期，衰老早期，衰老中期和衰老晚期的剑叶进行取材，运用TCA-丙酮法和PEG预分离法提取...
一.水稻种子:93-11(籼稻,已测序) 二.种子发芽: 先用5%的次氯酸钠消毒1小时,在370 C条件下浸泡24小时,随后将浸泡的种子平铺(密度稀)在玻璃培养皿上,黑暗下发芽48小时,特别注意发芽时玻璃培养皿中不要留水,只让种子一直保持湿润即可;播种前,选取出芽比较一致的下种。 三.培养液: Hogland solution,配方如下。每...
(2006)03— 0309- -07 籼稻 93. 11 和粳稻 日本晴 DNA 插入缺失差异 片段揭示的水稻籼. 粳分化 蔡星星, 刘晶, 仇吟秋, 赵伟, 宋志平, 卢宝荣 (复旦大学 生物多样性科学研究所 生物多样性与生态工程教育部重点实验室, 上海200433) 摘价基于籼稻 93. 1l 和粳稻日本晴全基因组序列比对获得的差异片段而设计...
水稻日本晴和93-11基因组参考序列的质量分析
以“杂交水稻之父”袁隆平为首的育种专家一直致力于“高产优质”型超级水稻新品种的培育,取得了丰硕的成果。现拥有三种品系的水稻:“TQ”超高产但综合品质差;“93-11”拥有
分类号华中农业大学博士学位论文水稻日本晴和93.11基因组参考序列的质量分析QualityanalysisofriceNipponbareand93..11referencesequences博士研究生:学号:指导教师:指导小组:专业:生化与分子生物学获得学位名称:理学博士邓颖08304010029罗美中教授熊立仲教授张忠明教授刘子铎教授杨在清教授研究方向:植物基因组学获得学位时间:华中农...
93 11 和粳稻日本晴全基因组序列比对获得的差异片段而设计的 InDel 引物在鉴定籼稻和粳稻两种 生态型以及研究稻属不同物种之间亲缘关系的意义 采用 45 对 InDel 引物 对来自亚洲 10 个国家的 49 份籼稻 43 份粳稻品种和 24 份野生稻进行了检验 结果表明 其中 41 对 InDel 引物鉴定籼稻或粳稻品种的准确率高于 ...
《水稻直立穗突变体93-11ep的基因定位克隆及育种利用研究》是依托扬州大学，由严长杰担任项目负责人的面上项目。项目摘要 直立穗型是粳稻高产株型的重要特征，近年来已经越来越受到水稻遗传育种家的重视。现有研究表明高产粳稻品种的直立穗株型都与QTLqEP9-1有关，本课题组已经完成了该基因的精细定位。另外，我...