次级代谢产物生物合成基因簇基因组挖掘生物信息学为系统研究双歧杆菌(Bifidobacteria)次级代谢产物生物合成基因簇和毒力因子分布情况,本研究利用antiSMASH和PathoFact对1230株双歧杆菌全基因组序列进行了次级代谢产物生物合成基因簇和毒力因子预测分析.结果表明,25.77%的双歧杆菌基因组序列中含编码次级代谢产物生物合成基因簇,以...
生物合成基因簇是指一组在染色体上连续排列的基因,它们共同负责某一特定次级代谢产物的生物合成。这些基因包括结构基因、调节基因、耐药性基因和转运蛋白等,它们之间具有复杂的调控关系,共同构成了微生物次级代谢产物生物合成的分子基础。 在药物创新方面,微生物次级代谢产物生物合成基因簇的研究具有重要的意义。通过对生物...
微生物次级代谢产物合成基因簇预测分析
1.1微生物次级代谢产物生物合成基因簇的组成特点自从Malpartida等1984年克隆了放线紫红素的全部生物合成基因[3],以及随后克隆的榴菌素[4]、红霉素[5,6]、泰乐星等生物合成基因,揭示了微生物次级代谢产物生物合成基因成簇排列的特征,即与特定产物合成相关的结构基因、调节基因、耐药性基因和转运蛋白等集中位于染色体的一段...
成基因簇还具有 以下几个特点:①生物合成基 因一般形成几个不同的转录单? 项技术的高效性和巨大潜力。微生物次级代谢产物完整生物合成基因簇的克隆? 位;②通常含 有一 个 以上 的耐药性 基因 ,且 耐药性 基 因和结 构基 因表达 之 间有? 和功能分析使得生物合成途径及生物合成调控机理的阐明成为可能,从而...
氨基糖甙类/氨基环醇 ectoines四氢嘧啶 nucleosides核苷3 phosphoglycolipids磷酸糖脂 melanins黑素类 others 5 次级代谢产物简介 抗生素:抗细菌、抗真菌、抗病毒、抗肿瘤等酶抑制剂 免疫抑制剂 生理活性物质 受体拮抗剂 ……….. 6 次级代谢产物生物合成基因簇 次级代谢产物的编码基因通常在基因组中成簇存在,编码...
6 次级代谢产物生物合成基因簇 次级代谢产物的编码基因通常在基因组中成簇存在,编码 具有多种功能的复合酶 研究的最清楚为 NRPS :nonribosomal peptides synthetase PKS: polyketides synthetase NRPS-PKS hybrid 7 次级代谢产物生物合成基因簇 PKS和NRPS复合酶的基因主要是由连续的 模块(...
微生物产生众多结构和生物活*多样的次级代谢产物,其生物合成基因簇的克隆是*物创新和产量提高的必要前提.迄今为止已有超过150种生物合成基因簇通过各种方式被克隆,并被用于组合生物合成、体外糖类随机化、代谢工程的定向改造.我们研究室已经克隆并测定了氨基糖苷类井冈霉素/有效霉素、多烯类抗生素FR-008/克念菌素、聚醚...
摘要:为了更好地从肠道微生物组中挖掘新的次级代谢产物、了解肠道微生物组编码的抗生素耐药基因和毒力因子情况,本研究基于4 644株人体肠道微生物代表菌的基因组序列,对其编码的次级代谢产物基因簇、抗生素耐药基因和毒力因子进行了预测分析。...
部分或失活微生物占主要的次级代谢产物的生物合成基因簇,从而使微生物不产或极少产对应次级代谢产物,获得相对简单的次级代谢产物背景,然后通过培养条件的改变或遗传改造,使原本不表达或低量表达的次级代谢产物的产量显著提高,成为主要次级代谢产物,并利用化学或生物活性分析等方法进行检测,直至发现若干新的次级代谢...