《对域/肽识别中线性模体的结构生物信息学分析》是依托西南交通大学，由田菲菲担任项目负责人的青年科学基金项目。项目摘要 线性模体是在序列局部范围决定蛋白质特定生物学功能的氨基酸特征排列模式；先前对其研究多在一级序列水平开展，却无法阐释其行使生物职能的深层次分子基础。本项目拟利用目前丰富的蛋白质三维结构数据...
(2)通过量化磁共振成像时间序列之间的相互作用,根据节点之间的关系形成的网络拓扑结构,采用模体结构对大脑默认网络的有向连接进行分析,能够在更小的范围内研究默认脑区在大脑活动中的功能机制,进一步确定相关脑区形成的网络结构对网络的重要程度,提高对大脑神经活动研究的精确性。 (3)本发明在脑功能连接分析、脑功能诊...
构中螺旋记为“H”,折叠记为“E”。由此,超二级结构模体可分分四 类,Loop两端连接螺旋,则定义为HH;HE是Loop左端连接螺旋,右端 连接折叠;EH定义类似;EE是Loop两端连接两个折叠。本文对四类超二 级结构统计分析,得到蛋白质超二级结构中一些有用信息,可用于蛋白质结 ...
1. 蛋白质中五类超二级结构模体的统计分析 2. 蛋白质超二级结构序列片段的统计分析 3. 结合蛋白质二级结构信息预测蛋白质空间结构中的二硫键 4. 优化多核SVM的蛋白质二级结构预测 5. 基于改进牛顿算法的蛋白质二级结构预测 6. 基于条件随机场进行蛋白质二级结构预测 7. 复合编码支持向量机预测蛋白质二...
随着已知结构蛋白质数量的迅猛增加,从蛋白质的序列出发,通过理论计算方法对蛋白质的结构进行预测有着更高的效率和更低的成本.复杂超二级结构模体的预测是预测蛋白质的空间结构和功能研究的关键步骤.βαβ模体是一种重要的复杂超二级结构.因此,准确预测蛋白质复杂超二级结构βαβ模体,不仅对蛋白质的空间结构和功能...
模体中Loop的氨基酸长度从1到20个，经过统计发现loop长⼤多在2到8之间，所以选取loop氨基酸长为2到8的序列进⾏统计分析，四类超⼆级结构中Loop长为2-8的超⼆级结构序列⽚段个数见图1。2.⽅法 我们参照⽂献[3]的作法，对Loop长为2-8的五类超⼆级结构序列统计了各位点20种氨基酸出现概率。选取...
[目的]对蛋白质中的5类超二级结构模体进行统计分析。[方法]选取5类超二级结构模体序列片段为分析材料,对它们Loop位置上的20种氨基酸出现频率进行统计分析。[结果]5类模体在左1、右1、-3、-2、-1、1、2、3 6个位置上N、G、D、S、Q的含量较低,而I、V、L、E含量变化较大。[结论]在区分5类模体时可重点...
体和非βαβ模体作为研究对象;固定序列模式长为32个氨基酸。对βαβ模体和非βαβ 模体采取5种片段截取方式,并统计分析每一位点的氨基酸保守性。 (3)以序列信息,预测的结构信息和功能信息共同作为预测参数,使用支持向量 机方法预测复杂超二级结构βαβ模体。比较三个数据集的五交叉检验和独立检验的 ...
蛋白质中五类超二级结构模体的统计分析 [目的]对蛋白质中的5类超二级结构模体进行统计分析。[方法]选取5类超二级结构模体序列片段为分析材料,对它们Loop位置上的20种氨基酸出现频率进行统计分析。[结果]5类... 李彩艳,丁海麦 - 《安徽农业科学》 被引量: 0发表: 2012年 ...